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Q) PDBエントリーが巨大構造であるかどうかはどこに記載されていますか?

A) PDBx/mmCIFまたはPDBMLで、pdbx_database_status.pdb_format_compatibleを見ると、そのエントリーが巨大構造であるかどうかが判別できます。 直接ファイル内を参照する意外に、CIF queryサービスや、SQL searchサービスを使って、この項目を参照することができます。 この要素の値として「Y」が設定されていれば非巨大構造(従来同様PDB formatも提供)、「N」が設定されていれば巨大構造(ChainIDを読み替え、複数のPDB formatファイルとChainID対応情報を含めたPDB bundleを提供)です。

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2015-03-26 (last edited: 10 months ago)2016-04-18
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