3-3) 解析した構造を評価するために、OneDep検証サービスのパッケージは利用できますか？ - validation FAQ -

wwPDBの検証サーバ（https://validate.wwpdb.org）をご利用頂くことで、構造を評価することができます。

また、Pythonパッケージをインストールすることで、OneDepの検証サービスを、Python APIを使ってご利用頂けます。 詳細は、以下のページをご覧ください。
http://wwpdb.org/validation/onedep-validation-web-service-interface