| PDB ID PDB IDは重複しない４文字のコー ... |
| PDBアーカイブデータの２段階公開処理へ、結晶化pHの値が追加されます PDBアーカイブデータの２段階公開 ... いる蛋白質構造データバンク（PDB）のアーカイブデータの公開処理 ... |
| PDBデータを登録する際は、ORCIDコードと助成金情報を入力してください。 PDBデータを登録する際は、ORCIDコード ... りよくするために、登録者がPDBデータを登録する際に、 ORCIDコード ... ため、このコードを使用すると、PDBやBMRB、EMDBエントリーの著者が誰 ... |
| PDBアーカイブの2017年1月1日付けのスナップショットを公開しました。 PDBアーカイブの2017年1月1日付 ... ました。 2017年1月1日現在の、PDBアーカイブ (ftp://ftp.pdbj.org) のスナッ ... ップショットをアーカイブし、PDBアーカイブに関する研究に役 ... 。 座標データは、PDBx/mmCIFフォーマット、PDBフォーマット、XMLフォーマットフ ... |
| PDB形式変換不可エントリー ... 下のいずれかの理由により、PDBフォーマットでは表現できず ... は、旧来から利用されているPDBフォーマットでは統合エント ... ないことです。そこで、wwPDBではPDBフォーマットを後継のPDBx/mmCIFフ ... できないため、wwPDBでは複数のPDBフォーマットファイルに変換 ... したファイル群（pdb bundle）を提供し、引き続き巨大構 ... |
| PDBアーカイブファイルのPDBx/mmCIF辞書のバージョンが、V4からV5へ更新されます。 ... からV5へ更新されます。 wwPDBは、PDBアーカイブの全てのエントリ ... ://wwpdb.org/deposition/system-information、 日本語版) は、現在PDBで受け付けられる実験手法 ... 、 テスト用FTP領域 (ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/test_data/EM/) に含まれますが、2017年 ... れます。 2017年7月には、現在のPDB FTPアーカイブにあるファイル ... |
| PDBアーカイブのX線結晶構造について、検証レポートが更新されます。 ... が更新されます。 2016年3月に、PDBアーカイブの全てのX線結晶 ... には、2015年12月30日時点での、PDBアーカイブの構造情報が反映 ... ます。 - ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/validation_reports/ (wwPDB/RCSB PDB) - ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/pdb/validation_reports/ (PDBe) - ftp://ftp.pdbj ... |
| PDBデータの書式 ... - 詳しくは wwPDB/RDF をご覧下さい。 PDBデータはRDF（Resource Description Framework）形式でも参 ... 義していますが、その内容はPDB mmCIF Exchange Dictionaryに基づいています。 ... リー 1GOF のRDFデータは http://rdf.wwpdb.org/pdb/1GOF からアクセスできます。 - http ... ://rdf.wwpdb.org/pdb... wwPDB/RDFデータの単純な（ヒトでも ... |
| PDBアーカイブのX線結晶構造に対して、wwPDBの検証レポートが更新され、ご利用頂けるようになりました。 ... た。 2016年3月9日から、PDBアーカイブの全てのX線結 ... 2015年12月30日時点での、PDBアーカイブの構造情報が ... (wwPDB) - ftp://ftp.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/ (RCSB PDB) - ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/pdb/validation_reports/ (PDBe) - ftp://ftp.pdbj ... ージョンのアーカイブは、RCSB PDBとPDBjに納められています。 こ ... |
| PDB Bundle ... 引用文献の詳細、座標データ等、PDB形式変換不可エントリーに対 ... ましては、以下のFTP siteから、PDB bundle (PDBID-pdb-bundle.tar.gz) ファイルをダウ ... い。 ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/compatible/pdb_bundle (wwPDB/RCSB PDB) ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/pdb/compatible/pdb_bundle (PDBe) ftp://ftp.pdbj.org ... |
| PDBのエントリー数が10万件を突破しました ... for Structural Bioinformatics Protein Data Bank (RCSB-PDB; http://rcsb.org)と、NMR実験データを ... 4311, nahokohprotein.osaka-u.ac.jp 図 ２： PDBに登録された多様で複雑な ... 1fka, 1ffk), 8. シャペロン (1aon). Figure references Myoglobin (PDB ID 1mbn): J. C. Kendrew, G. Bodo, H. M. ... |
| PDBアーカイブ / スナップショットアーカイブからのダウンロード ... level of pdb_versioned data ftp tree aproximately 237G ( /pdb_versioned ) pdb_nextgen Top level of NextGen PDB archive tree approximately 85G ( /pdb_nextgen ) ... delete rsync.pdbj.org::ftp_data/structures/divided/pdb/ ./pdb 全てのPDB exchange (mmCIF) フォーマットのフ ... |
| PDBの生物学的構造単位について ... て結合する必要のあるPDB IDはPDBフォーマットファイル ... て結合する必要のあるPDB IDはPDBフォーマットファイル ... アーカイブ：ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/biounit （PDBフォーマットで提供されて ... K. Henrick, H.M. Berman (2008) Representation of viruses in the remediated PDB archive. Acta Cryst. D64: 874-882 3. K. Henrick, J.M ... |
| PDBエントリー1a14に含まれる残基の数を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリー1a14に含まれる残基 ... |
| PDBエントリー 1nov の生物学的単位に関する情報を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリー 1nov の生物学的単位 ... |
| PDBエントリー 1gof の citation_author カテゴリの内容を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリー 1gof の citation_author カテゴリ ... |
| PDBエントリー「1gof」の概要情報を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリー「1gof」の概要情報を得 ... |
| PDB IDの全件数を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDB IDの全件数を得る 検索はこ ... |
| PDBエントリー 1iqq のP値（密度値、exptl_crystal/density_percent_sol の値）を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリー 1iqq のP値（密度値、exptl_ ... |
| PDBエントリー 1iqq の文献のDOI（citation/pdbx_database_id_DOI の値）を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリー 1iqq の文献のDOI（citation/pdbx_ ... |
| PDBエントリー 1ao8 と 1ai9 それぞれの文献に対する PubMed ID（citation/pdbx_database_id_PubMed の値）を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリー 1ao8 と 1ai9 それぞれの ... |
| PDBエントリーとUniProt IDとの対応情報を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリーとUniProt IDとの対応情 ... |
| PDBエントリー 1iqq の文献のPubMed ID（citation/pdbx_database_id_PubMed の値）を得る - 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - PDBエントリー 1iqq の文献のPubMed ID（citation/ ... |
| PDBのXMLフォーマットやサービスについて -FAQ Q) PDBのXMLフォーマットやサービスに ... |
| PDBのXML Schema -FAQ Q) PDBのXML文書に対するXML Schemaはどこにありますか？ A) PDBML、PDBMLaddに対するXML Schemaは下記をご覧ください。 - PDBML - PDBMLadd [質問一覧に戻る] |
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