PDBjで登録処理したPDBエントリーの数が5万件に到達しました ... した! この数は全登録数の約1/4に相当します。 詳細は以下 ... 20年- 世界のPDBデータの4分の1相当 5万件に到達!|研究成果 ... |
文字列置換(REPLACE)、コードでの文字指定(CHR) ... 13になります。 例:列「カラム名1」の値から改行(LF)を除去した ... 内容を得る SELECT REPLACE( カラム名1, CHR(10), ) FROM テーブル名 |
PDBjウェブインターフェースのカスタマイズ ... ります。 パネルのタイトルを1回クリックするとメニューが ... 側のメニューを表しています。 1回ボタンを押すと、そのメニ ... |
10月5日(金)「トーゴーの日シンポジウム2018」にて、口頭・ポスター発表を行います ... 館) 口頭発表 (講演プログラム) 1. 10月5日(金)11:35~11:50「 蛋白質 ... 研究所) ポスター発表 (日程・一覧) 1. No. 9 「 Linked Open Dataを利用するアラ ... |
ProMode-Elasticとは何か ... めに計算から除外している。 (1) 独立変数と分子構造の記述 ... で表す必要がある。剛体部分(1つあるいは複数の原子から ... |
高分子鎖の中にD体アミノ酸でできたポリペプチド(polypeptide(D))だけを含むエントリーのPDBIDを得る ... /sql?query=SELECT+pdbid%0AFROM+brief_summary+%0AWHERE+('{1}'+こちら SELECT pdbid FROM brief_summary WHERE ('{1}' <@ chain_type_ids) AND NOT ('{2,3 ... |
テキストの全文検索(照合、@@) ... し、マッチしたデータの カラム1 を出力。検索の際、英語として ... ・変化型等を考慮。 SELECT カラム名1 FROM テーブル名 WHERE plainto_tsquery(english,string) @@ カラ ... |
2016年9月30日に、従来の登録システム AutoDep、ADIT-NMR、EMDepを終了しました。 ... 、ADIT-NMR、EMDepを終了しました。 2014年1月に、wwPDBは、X線結晶構造に対 ... リアルもご覧ください。 2016年1月8日には、X線結晶構造に ... |
[wwPDB] 2021年6月にSHEETとリガンドのSITEレコードへの対応を変更します ... す。 例えば、PDBエントリー5wlnでは、1つのタンパク質の複数のコ ... を形成するベータシート内では、1本のベータ鎖が片側で複数の ... |
ニュース (2016年3月31日) ... 開始できなくなります。 2014年1月に、wwPDBは、X線結晶構造に対 ... リアルもご覧ください。 2016年1月8日には、X線結晶構造に ... |
ニュース (2016年4月21日) ... 下の通りです。 日時 2016年5月1日(日)13:00〜16:30 会場 大阪大学 ... 阪府吹田市山田丘3-2) 本館1階セミナー室 [Map] [Google Map] ※本館正面 ... |
立体構造予測 ... タクトオーダ(residue-wise contact order)を含む1次元の蛋白質立体構造予測 ... いますが、構造予測にはまだ1種類しか選択できません。将 ... |
分子情報 ... トリーに含まれる各高分子の1文字表記配列情報をつなげ ... する数値で指定して下さい。 - 1. D体アミノ酸でできたポリ ... |
SIFTS SIFTSとは? SIFTS*1 (Structure integration with function, taxonomy and sequence) は PDB のデータ ... [] -- The same as above but in an array of text (for convenience). ); *1) Velankar et al., Nucleic Acids Research 41, D483 (2013) |
12/3(火)~6(金)に福岡で開催される第42回 日本分子生物学会年会に出展します ... 岡県福岡市博多区沖浜町7−1) JR博多駅からバス約15分 出 ... 岡県福岡市博多区石城町2−1) JR博多駅からバス約12分 資 ... |
[wwPDB] PDB IDを変更せずに、公開済みのPDBエントリーの座標を改善できます(第2段階) ... 。 座標の変更は、年間に1エントリー当たり1回まで、一人の研究 ... |
国際結晶学会(8月5-12日)でのwwPDB関連イベントのお知らせ ... M. Berman (RCSB PDB) in MS61 The Beginnings Of Biological Crystallography (1:45 - 4:20pm) in Room 517d. "ポスター発表: Educational ... Helen M. Berman (RCSB PDB) in MS61 The Beginnings Of Biological Crystallography (1:45 - 4:20pm) in Room 517d. - "ポスター発表: ... |
11/30(土)ららぽーとEXPOCITYにて開催される「2019大阪大学共創DAY@EXPOCITY」にブースを出展します ... 阪府吹田市千里万博公園2−1) 「大阪モノレール万博記念公園 ... 駅」下車徒歩約2分 出展場所 1階「光の広場」 出展タイトル タ ... |
ニュース (2014年4月24日) ... クヘブン国立研究所(Brookhaven National Laboratory)1で、実験的に決定した生物学 ... はこちらからご覧頂けます。 1. Protein Data Bank. (1971) Protein Data Bank. Nature New Biol. 233: 223 ... |
2015年7月19日より、X線結晶構造の登録には、wwPDBの新登録ツールのみご利用頂けます。 ADITによる登録受付は完全に終了します。 ... 付は完全に終了します。 2015年1月27日付けのニュースでお知 ... でに完了してください。 2014年1月27日に、wwPDBは、新しい登録及 ... |
12月6日~9日、ConBio2017 生命科学系学会合同年次大会にて、ブース出展とフォーラム発表を行います。 ... - 会場:神戸国際展示場 2号館 1階 バイオデータベースコーナー(BioDBコ ... 戸ポートピアホテル 本館 地下1階 布引) - PDBjからの発表者: 鈴木 ... |
[wwPDB] OneDepでPDB IDを変更せずに、公開済みのPDBエントリーの座標を改善できます ... 。 座標の変更は、年間に1エントリー当たり1回まで、一人の研究 ... |
高分子鎖の中にD体とL体両方のポリペプチド鎖を含むエントリーのPDBIDを得る ... は |
これまでにない完全なHIVカプシド構造がPDBで公開されました ... える大きな構造についても、1つのPDBx/mmCIF、 PDBML/XMLファイルとし ... -5639/map/emd_5639.map.gz 参考文献 Mature HIV-1 capsid structure by cryo-electron microscopy and all-atom molecular dynamics. Gongpu ... |
構造ビューアでスケールを表示 - 万見(JSmol) ... の表示例を以下に示します。 1. 万見にアクセス 万見にアク ... リック axes on; axes unitcell; axes ticks x {10,5,1} format ["%0.0f"]; axes lables "X(Å)" "" "" 6. 「close」をクリッ ... |