| wwPDBでは、1970年代から使われてきた「PDBフォーマット」に替わり、2014年から新しい標準フォーマット（PDBx/mmCIF）の利用を開始する予定です。 ... は、1970年代から使われてきた「PDBフォーマット」に替わり、2014年か ... |
| [wwPDB] 今すぐ寄付をしてPDBの公開、協力、教育の精神をご支援ください ... 問委員会など将来に渡ってPDBアーカイブを維持する上で重 ... |
| 7-1) PDBでは、RSRZをどのように計算していますか？ - validation FAQ - ... ち、RSRZにより、ある分解能でのPDB構造に対して、特定の残基タ ... |
| 3-5) PDBフォーマットには適合しない、99,999個以上の原子や62本以上のポリマー鎖を含むエントリーを登録できますか？ - wwPDB D&A FAQ - ... 生成する演算子（行列変換）をPDBに提供する必要があります ... |
| PDBj が編集処理を行ったPDB登録数が2万件に達しました PDBj が編集処理を行ったPDB登録数が2万件に達しまし ... た。 PDBj は、2000年にPDBエントリーの編集処理を開始 ... |
| 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイルで記述できない大きな構造）のPDBIDを得る ... 索 - 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイルで記述 ... ちら SELECT pdbid FROM pdbx_database_status AS e WHERE e.pdb_format_compatible='N' タグ - エントリー情報 - 情 ... |
| 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイルで記述できない大きな構造）のPDBIDとポリマー鎖数を得て、ポリマー鎖数の少ない順（昇順）に表示する ... 索 - 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイルで記述 ... _status e1 JOIN entity e2 ON e1.pdbid=e2.pdbid WHERE e1.pdb_format_compatible='N' AND e2.type='polymer' GROUP BY e1.pdbid ORDER ... |
| PDBID 1a14 のentity_id（鎖、分子ごとの識別ID）、label_asym_id（PDBで系統的に定義したChainID）とauth_asym_id（構造登録者が定義したChainID）との対応情報を得る ... （鎖、分子ごとの識別ID）、label_asym_id（PDBで系統的に定義したChainID）とauth ... DISTINCT e1.entity_id, e2.asym_id AS label_asym_id, e2.pdb_strand_id AS auth_asym_id FROM entity_poly e1 LEFT JOIN ... |
| ある化合物を含むPDBエントリーの検索 - FAQ Q) ある化合物が含まれたPDBエントリーを検索するにはど ... て下さい。ヒットしなければ、PDBには登録されていない可能 ... |
| 構造因子ファイルを持つPDBエントリーの検索 - FAQ ... 因子ファイルを持っているPDBエントリーを検索するにはど ... うすればいいですか？ A) PDB最新情報ページの「構造因子エ ... |
| wwPDBは、2014年2月に、PDBアーカイブの全てのX線結晶構造について、検証レポートを公開します。 wwPDBは、2014年2月に、PDBアーカイブの全てのX線結晶 ... 、容易に解釈することができ、PDBデータの利用者は、アーカイブ中 ... |
| [wwPDB] PDBアーカイブから、NMR実験データを統合フォーマットで提供します ... イルとしてNMRの実験データをPDB FTPアーカイブ上に配置します ... 発しています。ファイル名はPDBアクセションコードで始まり ... |
| [wwPDB] PDB登録への５つのステップ 構造をPDBへ登録する準備ができてい ... ドが役に立ちます。 OneDepによるPDB登録への５つのシンプルな ... |
| Mine PDB Explorer インタフェース mine PDB Explorerのインタフェースは、以下の ... 、そのエントリーに対するSequence Navigator (PDB内の相同蛋白質検索)の結果 ... |
| 379件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2024-07-10付） 379件のPDBエントリーが新たに公開されました。 公開済みのPDBエントリーは、222415件になりました。（2024-07-10付） その他の更新情報は、PDB / EMDB 最新情報ページをご覧ください。 |
| [wwPDB] PDBアーカイブの2019年1月1日付けのスナップショットを公開しました 2019年1月1日現在の、PDBアーカイブ (wwPDB:ftp://ftp.wwpdb.org、 PDBj:ftp://ftp. ... ップショットをアーカイブし、PDBアーカイブに関する研究に役 ... ファイルは、PDBx/mmCIFフォーマット、PDBフォーマット、XMLフォーマットフ ... |
| [wwPDB] 10,000件の区切りのPDBデータを処理した研究員 ... 見学有美子さんが処理したPDBエントリーが10,000件に到達し ... 存知と思います。 見学さんはPDBの編集作業を通じて，20年以 ... 上にわたり多くのPDB登録者とともに，高精度エン ... |
| [wwPDB] PDBアーカイブの2018年1月1日付けのスナップショットを公開しました。 2018年1月1日現在の、PDBアーカイブ (wwPDB:ftp://ftp.wwpdb.org、 PDBj:ftp://ftp. ... ップショットをアーカイブし、PDBアーカイブに関する研究に役 ... ファイルは、PDBx/mmCIFフォーマット、PDBフォーマット、XMLフォーマットフ ... |
| [wwPDB] 10,000件以上のPDB登録を処理したバイオキュレータ wwPDBの張 羽澄さんが処理したPDBエントリーが10,000件に到達し ... 器病研究センター勤務を経てPDBに加わりました。 2007年に ... PDBに加わり、現在は大阪の蛋白 ... |
| PDBjで登録処理したPDBエントリーの数が5万件に到達しました ... に渡ってPDBjで処理してきたPDB登録処理件数が5万件に達 ... 界の蛋白質構造データバンク（PDB）を運営して20年- 世界の ... PDBデータの4分の１相当 5万件 ... |
| フォーマット変換: ファイルフォーマットをPDBフォーマット - PDBx/mmCIF の間で変換するサービスはありますか - FAQ ... 変換: ファイルフォーマットをPDBフォーマット - PDBx/mmCIF の間で変換 ... 換のウェブサービスを使ってPDBフォーマットファイルをPDBx/mmCIF ... きます。 また逆方向（PDBx/mmCIFからPDBフォーマット）への変換も可能 ... |
| [wwPDB] wwPDBからPDBアーカイブをダウンロードする際のドメイン名が変わります wwPDBでは、PDBアーカイブのデータをダウンロー ... ：rsync://ftp.wwpdb.org) 詳細は、wwPDBサイトのPDBアーカイブのダウンロードページ ... ります。 プログラムを使ってPDBアーカイブデータをダウンロード ... |
| 4-1) 既存のPDBエントリーについて、検証レポートを取得できますか？ - validation FAQ - ... トからもご利用頂けます。 （RCSB PDB、 PDBe、 PDBj） |
| [wwPDB] PDBフォーマットファイルの凍結 ... ーマットはPDBx/mmCIFとなっており、PDBファイルフォーマットの開発 ... ォーマットは更新されますが、PDBフォーマットは旧バージョンの ... ついては、 wwPDBサイト（File Formats and the PDB）をご覧ください。 [ wwPDB ニュース ... |
| [wwPDB] 10,000件以上のPDB登録を処理したバイオキュレータ ... キュレーター Yuhe Liang氏が処理したPDBエントリーが10,000件に到達し ... に関する研修に従事した後、PDBに加わりました。 Yuhe Liang RCSBの ... PDBでの10年にわたるキャリア ... |
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件を2024-07-10に公開中
