キーワード(struct_keywords.pdbx_keywords)とそのキーワードが定義されているPDBエントリーの件数を得る(件数の多い順、大文字小文字の区別なし) ... のキーワードが定義されているPDBエントリーの件数を得る(件数 ... |
[wwPDB] PDBアジア地区50周年記念シンポジウムの開催 11月24日にオンラインにて「PDBアジア地区50周年記念シン ... |
PDBj Mine(PDBjにおけるPDBデータ検索サービス)の使い方 - FAQ ... ) PDBj Mine検索サービス(PDBjにおけるPDBデータ検索サービス)の使い方に ... |
3-5) PDBフォーマットには適合しない、99,999個以上の原子や62本以上のポリマー鎖を含むエントリーを登録できますか? - wwPDB D&A FAQ - ... 生成する演算子(行列変換)をPDBに提供する必要があります ... |
wwPDBは、2014年2月に、PDBアーカイブの全てのX線結晶構造について、検証レポートを公開します。 wwPDBは、2014年2月に、PDBアーカイブの全てのX線結晶 ... 、容易に解釈することができ、PDBデータの利用者は、アーカイブ中 ... |
PDBj が編集処理を行ったPDB登録数が2万件に達しました PDBj が編集処理を行ったPDB登録数が2万件に達しまし ... た。 PDBj は、2000年にPDBエントリーの編集処理を開始 ... |
Mine PDB Explorer インタフェース mine PDB Explorerのインタフェースは、以下の ... 、そのエントリーに対するSequence Navigator (PDB内の相同蛋白質検索)の結果 ... |
[wwPDB] PDBアーカイブから、NMR実験データを統合フォーマットで提供します ... イルとしてNMRの実験データをPDB FTPアーカイブ上に配置します ... 発しています。ファイル名はPDBアクセションコードで始まり ... |
[wwPDB] PDB登録への5つのステップ 構造をPDBへ登録する準備ができてい ... ドが役に立ちます。 OneDepによるPDB登録への5つのシンプルな ... |
巨大構造エントリー(1つのPDBフォーマットファイルで記述できない大きな構造)のPDBIDとポリマー鎖数を得て、ポリマー鎖数の少ない順(昇順)に表示する ... 索 - 巨大構造エントリー(1つのPDBフォーマットファイルで記述 ... _status e1 JOIN entity e2 ON e1.pdbid=e2.pdbid WHERE e1.pdb_format_compatible='N' AND e2.type='polymer' GROUP BY e1.pdbid ORDER ... |
巨大構造エントリー(1つのPDBフォーマットファイルで記述できない大きな構造)のPDBIDを得る ... 索 - 巨大構造エントリー(1つのPDBフォーマットファイルで記述 ... ちら SELECT pdbid FROM pdbx_database_status AS e WHERE e.pdb_format_compatible='N' タグ - エントリー情報 - 情 ... |
PDBID 1a14 のentity_id(鎖、分子ごとの識別ID)、label_asym_id(PDBで系統的に定義したChainID)とauth_asym_id(構造登録者が定義したChainID)との対応情報を得る ... (鎖、分子ごとの識別ID)、label_asym_id(PDBで系統的に定義したChainID)とauth ... DISTINCT e1.entity_id, e2.asym_id AS label_asym_id, e2.pdb_strand_id AS auth_asym_id FROM entity_poly e1 LEFT JOIN ... |
ある化合物を含むPDBエントリーの検索 - FAQ Q) ある化合物が含まれたPDBエントリーを検索するにはど ... て下さい。ヒットしなければ、PDBには登録されていない可能 ... |
構造因子ファイルを持つPDBエントリーの検索 - FAQ ... 因子ファイルを持っているPDBエントリーを検索するにはど ... うすればいいですか? A) PDB最新情報ページの「構造因子エ ... |
294件のPDBエントリーが新たに公開されました。(2024-06-12付) 294件のPDBエントリーが新たに公開されました。 公開済みのPDBエントリーは、221051件になりました。(2024-06-12付) その他の更新情報は、PDB / EMDB 最新情報ページをご覧ください。 |
[wwPDB] 10,000件の区切りのPDBデータを処理した研究員 ... 見学有美子さんが処理したPDBエントリーが10,000件に到達し ... 存知と思います。 見学さんはPDBの編集作業を通じて,20年以 ... 上にわたり多くのPDB登録者とともに,高精度エン ... |
[wwPDB] wwPDBからPDBアーカイブをダウンロードする際のドメイン名が変わります wwPDBでは、PDBアーカイブのデータをダウンロー ... :rsync://ftp.wwpdb.org) 詳細は、wwPDBサイトのPDBアーカイブのダウンロードページ ... ります。 プログラムを使ってPDBアーカイブデータをダウンロード ... |
PDBjで登録処理したPDBエントリーの数が5万件に到達しました ... に渡ってPDBjで処理してきたPDB登録処理件数が5万件に達 ... 界の蛋白質構造データバンク(PDB)を運営して20年- 世界の ... PDBデータの4分の1相当 5万件 ... |
[wwPDB] 10,000件以上のPDB登録を処理したバイオキュレータ wwPDBの張 羽澄さんが処理したPDBエントリーが10,000件に到達し ... 器病研究センター勤務を経てPDBに加わりました。 2007年に ... PDBに加わり、現在は大阪の蛋白 ... |
[wwPDB] PDBフォーマットファイルの凍結 ... ーマットはPDBx/mmCIFとなっており、PDBファイルフォーマットの開発 ... ォーマットは更新されますが、PDBフォーマットは旧バージョンの ... ついては、 wwPDBサイト(File Formats and the PDB)をご覧ください。 [ wwPDB ニュース ... |
フォーマット変換: ファイルフォーマットをPDBフォーマット - PDBx/mmCIF の間で変換するサービスはありますか - FAQ ... 変換: ファイルフォーマットをPDBフォーマット - PDBx/mmCIF の間で変換 ... 換のウェブサービスを使ってPDBフォーマットファイルをPDBx/mmCIF ... きます。 また逆方向(PDBx/mmCIFからPDBフォーマット)への変換も可能 ... |
[wwPDB] PDBアーカイブの2019年1月1日付けのスナップショットを公開しました 2019年1月1日現在の、PDBアーカイブ (wwPDB:ftp://ftp.wwpdb.org、 PDBj:ftp://ftp. ... ップショットをアーカイブし、PDBアーカイブに関する研究に役 ... ファイルは、PDBx/mmCIFフォーマット、PDBフォーマット、XMLフォーマットフ ... |
4-1) 既存のPDBエントリーについて、検証レポートを取得できますか? - validation FAQ - ... トからもご利用頂けます。 (RCSB PDB、 PDBe、 PDBj) |
[wwPDB] PDBアーカイブの2018年1月1日付けのスナップショットを公開しました。 2018年1月1日現在の、PDBアーカイブ (wwPDB:ftp://ftp.wwpdb.org、 PDBj:ftp://ftp. ... ップショットをアーカイブし、PDBアーカイブに関する研究に役 ... ファイルは、PDBx/mmCIFフォーマット、PDBフォーマット、XMLフォーマットフ ... |
[wwPDB] PDBアーカイブに関する新しい論文が、NARのデータベース特集号に掲載されました ... ータベース特集号(Database issue)において、PDBアーカイブに関する論文 「Protein Data ... 3D macromolecular structure data」が出版されました。 PDBアーカイブの運営においては ... ータの修正作業等、wwPDBの下でのPDBの開発について述べていま ... ミュニティの交流の重要性、PDBが直面する科学や技術の課 ... |