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キーワード(struct_keywords.pdbx_keywords)とそのキーワードが定義されているPDBエントリーの件数を得る(件数の多い順、大文字小文字の区別なし)

... のキーワードが定義されているPDBエントリーの件数を得る(件数 ...

UniProt Accession IDが「Q00526」であるPDBエントリー一覧を得る

... Mine - SQL検索 - UniProt Accession IDが「Q00526」であるPDBエントリー一覧を得る 検索は ...

キーワードとそのキーワードが定義されているPDBエントリーの件数を得る(表示順は件数の多い順でキーワードの大文字小文字は区別なし、件数が多いものから順に並 ...

... のキーワードが定義されているPDBエントリーの件数を得る(表示 ...

3-5) PDBフォーマットには適合しない、99,999個以上の原子や62本以上のポリマー鎖を含むエントリーを登録できますか? - wwPDB D&A FAQ -

... 生成する演算子(行列変換)をPDBに提供する必要があります ...

PDBエントリーのタイトル(pdbx_descriptor)、キーワード(pdbx_keywords)、単位格子の3辺の長さと角度、高分子鎖の数、高分子鎖の合計化学式量を得る

- 検索サービス - PDBj Mine - SQL検索 - 各PDBエントリーのタイトル(pdbx_descriptor)、キー ...

PDBj Mine(PDBjにおけるPDBデータ検索サービス)の使い方 - FAQ

... ) PDBj Mine検索サービス(PDBjにおけるPDBデータ検索サービス)の使い方に ...

wwPDBでは、1970年代から使われてきた「PDBフォーマット」に替わり、2014年から新しい標準フォーマット(PDBx/mmCIF)の利用を開始する予定です。

... は、1970年代から使われてきた「PDBフォーマット」に替わり、2014年か ...

7-1) PDBでは、RSRZをどのように計算していますか? - validation FAQ -

... ち、RSRZにより、ある分解能でのPDB構造に対して、特定の残基タ ...

遺伝子オントロジー(GO)のbiological_processカテゴリtricarboxylic acid cycleに関連づけられているPDBエントリーのPDBID一覧を得る

... acid cycleに関連づけられているPDBエントリーのPDBID一覧を得る 検 ...

PDBj が編集処理を行ったPDB登録数が2万件に達しました

PDBj が編集処理を行ったPDB登録数が2万件に達しまし ... た。 PDBj は、2000年にPDBエントリーの編集処理を開始 ...

[wwPDB] 10,000件以上のPDB登録を処理したバイオキュレータ

wwPDBのIrina Persikova博士が処理したPDBエントリーが10,000件に到達し ... 物理学の博士号を取得後、RCSB PDBに20年以上勤務してきまし ...

巨大構造エントリー(1つのPDBフォーマットファイルで記述できない大きな構造)のPDBIDを得る

... 索 - 巨大構造エントリー(1つのPDBフォーマットファイルで記述 ... ちら SELECT pdbid FROM pdbx_database_status AS e WHERE e.pdb_format_compatible='N' タグ - エントリー情報 - 情 ...

巨大構造エントリー(1つのPDBフォーマットファイルで記述できない大きな構造)のPDBIDとポリマー鎖数を得て、ポリマー鎖数の少ない順(昇順)に表示する

... 索 - 巨大構造エントリー(1つのPDBフォーマットファイルで記述 ... _status e1 JOIN entity e2 ON e1.pdbid=e2.pdbid WHERE e1.pdb_format_compatible='N' AND e2.type='polymer' GROUP BY e1.pdbid ORDER ...

PDBID 1a14 のentity_id(鎖、分子ごとの識別ID)、label_asym_id(PDBで系統的に定義したChainID)とauth_asym_id(構造登録者が定義したChainID)との対応情報を得る

... (鎖、分子ごとの識別ID)、label_asym_id(PDBで系統的に定義したChainID)とauth ... DISTINCT e1.entity_id, e2.asym_id AS label_asym_id, e2.pdb_strand_id AS auth_asym_id FROM entity_poly e1 LEFT JOIN ...

[wwPDB] PDBアーカイブから、NMR実験データを統合フォーマットで提供します

... イルとしてNMRの実験データをPDB FTPアーカイブ上に配置します ... 発しています。ファイル名はPDBアクセションコードで始まり ...

構造因子ファイルを持つPDBエントリーの検索 - FAQ

... 因子ファイルを持っているPDBエントリーを検索するにはど ... うすればいいですか? A) PDB最新情報ページの「構造因子エ ...

Mine PDB Explorer

インタフェース mine PDB Explorerのインタフェースは、以下の ... 、そのエントリーに対するSequence Navigator (PDB内の相同蛋白質検索)の結果 ...

wwPDBは、2014年2月に、PDBアーカイブの全てのX線結晶構造について、検証レポートを公開します。

wwPDBは、2014年2月に、PDBアーカイブの全てのX線結晶 ... 、容易に解釈することができ、PDBデータの利用者は、アーカイブ中 ...

[wwPDB] PDB登録への5つのステップ

構造をPDBへ登録する準備ができてい ... ドが役に立ちます。 OneDepによるPDB登録への5つのシンプルな ...

ある化合物を含むPDBエントリーの検索 - FAQ

Q) ある化合物が含まれたPDBエントリーを検索するにはど ... て下さい。ヒットしなければ、PDBには登録されていない可能 ...

277件のPDBエントリーが新たに公開されました。(2025-07-02付)

277件のPDBエントリーが新たに公開されました。 公開済みのPDBエントリーは、238268件になりました。(2025-07-02付) その他の更新情報は、PDB / EMDB 最新情報ページをご覧ください。

[wwPDB] 10,000件の区切りのPDBデータを処理した研究員

... 見学有美子さんが処理したPDBエントリーが10,000件に到達し ... 存知と思います。 見学さんはPDBの編集作業を通じて,20年以 ... 上にわたり多くのPDB登録者とともに,高精度エン ...

[wwPDB] 10,000件以上のPDB登録を処理したバイオキュレータ

wwPDBの張 羽澄さんが処理したPDBエントリーが10,000件に到達し ... 器病研究センター勤務を経てPDBに加わりました。 2007年に ... PDBに加わり、現在は大阪の蛋白 ...

[wwPDB] wwPDBからPDBアーカイブをダウンロードする際のドメイン名が変わります

wwPDBでは、PDBアーカイブのデータをダウンロー ... :rsync://ftp.wwpdb.org) 詳細は、wwPDBサイトのPDBアーカイブのダウンロードページ ... ります。 プログラムを使ってPDBアーカイブデータをダウンロード ...

PDBjで登録処理したPDBエントリーの数が5万件に到達しました

... に渡ってPDBjで処理してきたPDB登録処理件数が5万件に達 ... 界の蛋白質構造データバンク(PDB)を運営して20年- 世界の ... PDBデータの4分の1相当 5万件 ...

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件を2025-07-02に公開中

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