... _scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero J 4 NAG 1 I NAG 1 A NAG 1310 n J 4 NAG 2 I NAG 2 ... A NAG 1311 n K 4 NAG 1 J NAG 1 A NAG 1312 n K 4 NAG 2 J NAG 2 ... A NAG 1313 n L 4 NAG 1 K NAG 1 A NAG 1315 n L 4 NAG 2 K NAG 2 ...

... 用） - sortBy: 並べ替え方法 (1: ヒットスコア, 2: 文献出版 ... 能の最大値 (Å) - method: 実験手法（1〜5の自然数、任意、指定がない ... て利用） - sortBy: 並べ替え方法 (1: ヒットスコア、 2: comp_id の ... て利用） - sortBy: 並べ替え方法 (1: ヒットスコア, 2: comp_idの ... て利用） - sortBy: 並べ替え方法 (1: ヒットスコア, 2: PDB IDの ... ールドが検索対象） - pdbid: PDBID（1-9の数字＋英数字3文字、任意 ...

... to_enzyme rdf:resource="http://purl.uniprot.org/enzyme/1.1.3.9" rdfs:label="enzyme:1.1.3.9"/>

... " /> 1 1"> ATOM 1 A A 1 1 ? . VAL VAL N N N 101.601 38.534 -1.962 1 .00 53.29 1 ... ? ATOM 1 A A 1 1 ...

... さい。

... 造ゲノミクス（SG）対象の１つです。 2czlを使ったSeSAWク ... 実行方法は以下の通りです。 1. PDB ID（2czl）、鎖ID（A）、電子メー ... will be useful for your research. Best wishes, -SeSAW もし１、２時間経ってもメールが来な ... 欲しい質問は次の２つです。 １）1wjk の機能は何なのか？ ... RIG-I のヘリカーゼドメイン 1. まず、モデルを作らなけれ ... ることにします。 ヒトのTLR-1（PDB:1fyv）から配列類似度27％ ...

... → [Animate] → [Palindrome]を選択する。 (7) xxxx_1-anm.xyz, xxxx_2-anm.xyz, ..., xxxx_10-anm.xyz ... → [Open-Local] → [Polygon] を選択し、xxxx_1-vec.xml、 xxxx_2-vec.xml、...、xxxx_10-vec.xml ... ーから [File] → [Open] を選択し、xxxx_1-vec.Jmol-script、 xxxx_2-vec.Jmol-script、 ...、 ...

... 公開・ダウンロードに関して - 1-1) 新しいPDBデータの公開・更新は ... 手することはできますか？ - 1-3) FTP又はrsyncを使用してPDB ... ードする方法を教えて下さい - 1-5) 機能情報（Functional Details）ページに掲 ... らダウンロードできますか？ - 1-6) OneDep登録サービスのチュート ... PDBjの検索サービスについて - 2-1) PDBjの各種検索サービスの利用 ... 違うのですか？ 5. その他 - 5-1) News Letterの宛先を変更していた ...

... 体構造に対して完全な１対１の比較（ペアワイズア ... added structures このパラメータは上記1.a. と似ていますが、ASHの ... added structures このパラメータは上記1.a. と似ていますが、ASHの ... from original このパラメータは上記1.b.と似ていますが、Uniref100 の ... アライメント結果 [参照文献] 1. Standley, Toh, Nakamura,ASH structure alignment package: sensitivity and ...

... （無料でダウンロードできます） 1. CRNPRED: Highly accurate prediction of one-dimensional protein structures ... オーダの予測） Kinjo, A. R.; Nishikawa, K. BIOPHYSICS 1 :67-74 (2005) [Basic methodology] 3. Recoverable one-dimensional ... 上記処理によって xml（xhtml 1.1）形式のページが myquery.xml とい ...

... str.gzと命名され、NMR-STAR (3.1) データフォーマットであること ... info@wwpdb.org にお寄せ下さい。 参考 1. JF Doreleijers, A Nederveen, W Vranken, J Lin, AM Bonvin ... coordinates from over 500 protein PDB structures. J. Biomol. NMR 32, 1-12. 2. WF Vranken, W Boucher, TJ Stevens, RH Fogh, ...

... /100d.rdf.gz chem_comp chem_comp/[0-9A-Z]{1,3}.rdf.gz 各化学グループのmmCIFの ... validation-alt.xml.gz [chem_comp] mmcif mmcif/[0-9a-z]{1,3}.cif.gz 各化合物エントリーの ... るPDBIDの一覧 - ccp4/([0-9a-z]{2})/[1-9]{1}[0-9a-z]{3}.ccp4.gz ... 電子密度 ... れたエントリーのPDBIDを1行に1つずつ記した以下のフ ...

... report FAQs （英語）をご覧ください。 1. レポートの種類 2. 検証レポー ... 内容（X線結晶解析） 1. レポートの種類 - 1-1) 検証レポートには、 ... どんな種類がありますか？ - 1-2) "Preliminary"な検証レポートでは ... 、何がPreliminaryなのですか？ - 1-3) 検証レポートには、異常値 ... 5. 検証レポートの内容 - 5-1) もし、検証レポートの内容が間 ... 内容（X線結晶解析） - 7-1) PDBでは、RSRZをどのように計算 ...

... ="2"> 2003-04-01 1 1GOF 2009-02-24 1 1GOF

... Reports Only) 20170710 July 10, 2017 snapshot 20180101 January 1, 2018 snapshot 20180321 March 21, 2018 snapshot (Validation ... Reports Only) 20190101 January 1, 2019 snapshot 20200101 January 1, 2020 snapshot 20200610 June 10, 2020 ...

... 子名を得る - 公開日が2000年1月1日以降であるエントリーのPDBID ... - 公開日が2003年1月1日以降、登録日が2001年1月1日以降で、PDBIDが「2k ... 報を得る - 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイル ... PDBIDを得る - 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイル ... 表示する - 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイル ...

... / 日本語(pdf 3.7M) - Vol.17 (2016年 1月) 英語(pdf 2.7M) / 日本語(pdf 3.0M ... ) - Vol.16 (2015年 1月) 英語(pdf 4.1M) / 日本語(pdf 3.3M ... 4M) / 日本語(pdf 3.1M) - Vol.10 No.1 (2008年 11月) 英語(pdf 3.6M) / 日本語 ... 2003年 12月) 英語(pdf 893K) / 日本語(pdf 1.5M) - Vol.2 (2003年 6月) 英語(pdf ...

... - E5 = SIGI-obs-neutron - E6 = R-free-flags-neutron dname file_number 1 - E1 = xray - E2 = xray - E3 = xray - E4 = neutron - E5 = neutron - E6 = ... 78 36 90 90 90 dwave file_number 1 crystal xray 1.0 dwave file_number 1 crystal neutron 1.0 END eof-cad [質問一覧 ...

... トは、2014年1月1日以降に公 ... params = "rdate_after=2014-01-01&method=1&res_max=1.8&sortBy=8" json_data = urllib.request. ... は、2021年1月1日以前に登 ... json_data) total <- data["total"] results <- data["results"][[1]] print(paste("total number of results:", total)) print("Printing the ...

... PDBj Mineトップページ PDB ID検索 1. 検索ボックスの右にあるプ ... 示されます。 キーワード検索 1. 検索ボックスの右にあるプ ... エントリーを検索します。 1. 検索ボックスの右にある ... 配列または核酸配列を１文字表記で入力して下さ ... エントリーを検索します。 1. 検索ボックスの右にある ... 例：Ito, N.）。『「姓」＋「,」（コンマ）＋「 」（空白）＋「名の１文字目」＋「.」（ピリオド）』という書式 ... す。 例： Ito, N. また著者名は１人しか指定できません。２人 ...

... FROM テーブル名 WHERE カラム名1=値1 AND カラム名2=値2 【書式 ... FROM テーブル名 WHERE カラム名1=値1 OR カラム名2=値2 【書式 ... 名 FROM テーブル名 WHERE NOT カラム名1=値1 例 Mammalia Order Family Genus Species Species_ja Primate ... Muridae Rattus norvegicus ドブネズミ 【例1】MammaliaテーブルからOrderの値が「Primate」 ...

... 3000構造ゲノムプロジェクト[1, 2]で解明された、仮想蛋白 ... れたP-valueを使っています（図１）。 図１：SeSAWスコアの頻度（左）とP-value ... タは、UniProtなどの情報源より１週間に１度のペースで抽出されま ... 寄生生物の一種）のROP16キナーゼ1型のホモロジーモデルを使っ ... ーの結果画面の様子 参考文献 1. Standley DM, Toh H, Nakamura H. Functional annotation by sequence-weighted ...

... all; wireframe off; cpk off; select all; backbone 200; select */1; color [150,255,150]; select */2; color [255,150,150]; ... ); Jmol.jmolCheckbox(jmolApplet0, "display displayed or */1","hide hidden or */1","GFPの表示",true); Jmol.jmolCheckbox(jmolApplet0, " ...

... 子種から除外されています。 1. D体アミノ酸でできたポリ ... . その他（other） 各PDBエントリーには1つ以上の分子が含まれてお ... て、PDBIDとentity IDを得る - EC番号が1.1.1.1であるエントリーのPDBID, entity ID, ChainID ... 値）を得る - 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイル ... 表示する - 巨大構造エントリー（1つのPDBフォーマットファイル ...

... http://pdbj.org/globe/globe.cgi [概要] 1. 球の中にある各点（陸に相当 ... http://pdbj.org/globe/globe.cgi?pdbid=1ashchain=Adomain=1 （PDBIDが「1ash」、鎖IDが「A」、ドメイン ... はありません。 [使い方] 1. Protein Globe のURL（上述）にア ... ://pdbj.org/globe/globe.cgi?pdbid=1ashchain=Adomain=1 このリンクをクリックする ...