| ニュース（2015年10月15日） ... 微鏡の三次元密度マップとPDBの原子モデルを比較する「Omokage ... |
| Molmilをウェブページに埋め込む方法 ... 、20行目のdata-pdbid="1crn"で読み込むPDBエントリー 1crn を指定していま ... |
| ニュース (2015年1月27日) ... が成功したことを受けて、RCSB PDBとPDBjは、2015年1月27日からは ... |
| wwPDBのNMR検証作業チームの提言をまとめた論文が公開されました ... せします（doi: 10.1016/j.str.2013.07.021）。 PDBに登録されている、NMRを使っ ... |
| UniProt ID（Swiss-Prot ID）での検索 - FAQ ... ID（Swiss-Prot ID）から、その蛋白質のPDBデータを探すのはどうすれば ... |
| 1月20日(水)、BINDS-PDBj講習会・蛋白研セミナー「データベース登録ノウハウ講習会」を開催します ... データの登録・配布については、PDBをはじめとする様々なデータベ ... 白質研究所) 14:05－14:30「最近のPDBの動向」栗栖 源嗣 (大阪大学 蛋 ... |
| [wwPDB] 非標準座標系で登録された結晶構造の改善 ... 座標系または空間群設定でPDBに登録された合計 268の構造 ... ルの座標やマトリックスは、 PDBのバージョン管理されたアーカ ... |
| 2013年6月12日（水）に、鳥取にて開催される第13回日本蛋白質科学会年会にて、 ランチョンセミナーを実施いたします。 ... 城 玲 （大阪大学蛋白質研究所） PDBの”新”フォーマット（The "new ... " PDB format) ※詳細は、発表の概要（pdf 617KB）を ... |
| 新しい辞書 （BIRD ：Biologically Interesting molecule Reference Dictionary）がFTPサイトから公開されました ... をご覧ください。 ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/bird/prd/ （PDBj FTPサイト） ftp://ftp.wwpdb.org ... |
| [wwPDB] PDB50: オンラインイベントの登録受付を開始しました 2021年を通して、wwPDBはPDBアーカイブの50周年を記念し ... ジタルデータリソースとしてのPDBの設立50周年を記念して、構 ... |
| ニュース (2012年03月07日) 2012年3月7日に、EMデータバンク(EMDB) がPDBアーカイブに追加されました。今後は PDBj の ftp サイト（ ftp://pdb.protein.osaka-u.ac.jp/pub/emdb ）からお使い頂けます。 過去のニュース もご覧ください。 |
| ニュース (2011年09月20日) ... 以降に実施予定の新PDBフォーマットや、PDB/RDFについて紹介して ... |
| PDBID一覧、件数 ... ともできます。 - 全PDBエントリーのPDBIDを得る - PDBエントリーの全件数 ... |
| [wwPDB] EMDBアーカイブの電子顕微鏡メタデータをPDBx/mmCIFファイル形式で配布します ... ブに追加されることで、EMDBとPDB（EM実験データと３次元構造）の ... /databases/emdb/structures/ - wwPDB: https://files.wwpdb.org/pub/emdb/structures/ - RCSB PDB (US): https://files.rcsb.org/pub/emdb/structures/ - PDBe (UK): https://ftp ... |
| スタッフ ... （大阪大学蛋白質研究所・教授） - PDB/EMDBデータベース構築グループ 中川 ... 学蛋白質研究所・特任研究員） - PDB/EMDBデータベース高度化グループ 水 ... |
| [wwPDB] 拡張されたPDBx/mmCIF構造因子ファイルに対してOneDepのサポートを改善しました ... 究室でのデータ処理/精密化とPDBへの登録との間でデータを失 ... 。 wwPDBは、構造生物学者に対して、PDB登録用のデータファイルを作 ... |
| 二次データベース ... （Elastic-network-model based normal mode analysis in Torsional Angle space for PDB data、二面角を独立変数とする ... 析計算プログラム）を使ってPDBデータの基準振動解析を行っ ... |
| 2022年日本バイオインフォマティクス学会年会、第11回生命医薬情報学連合大会にてランチョンセミナーを開催します ... 演題・演者 - 「PDBjの最近の活動とPDBデータの高度利用と活用促進 ... 源嗣（大阪大学蛋白質研究所) 「PDBデータの高度利用と活用促進 ... |
| [wwPDB] 論文「PDBx/mmCIF Ecosystem」 の掲載 ... ループによる新しい論文では、 PDBアーカイブに不可欠な構造生 ... し、 現代の蛋白質データバンク（PDB）アーカイブ（wwPDB.org）の基礎をつく ... |
| Molmilユーザマニュアル ... はありません。 - PDBx/mmCIF - PDBML (all-atom) - mmJSON - PDBフォーマット（フラットファイ ... 合物ID（ChemCompID）を指定するだけでPDBエントリーや化学物質エント ... |
| ニュース (2017年4月20日) ... ます。 蛋白質構造データバンク（PDB）では、生体分子の立体構造を ... 。 これらのメニューはいずれもPDBのデータを利用したものです ... |
| 実験情報 ... ）であるエントリーのPDBIDを得る - PDBエントリー 1iqq のP値（密度値、exptl ... り高く、鎖長が58残基以上のPDBエントリーの配列を得る |
| 機能情報 ... acid cycleに関連づけられているPDBエントリーのPDBID一覧を得る - Pfam ... り高く、鎖長が58残基以上のPDBエントリーの配列を得る |
| [wwPDB] CASP13のため蛋白質の立体構造を求めています。 ... するデータをお持ちであれば、PDB登録の際に、wwPDBのOneDep登録シス ... かつすぐに手続きできます。 PDBの公開前には構造を必要と ... |
| 対話型チュートリアル ... ートリアルをご覧ください。 ・各PDBエントリーのページも改訂され ... い機能が加わっています。 Mine PDB エクスプローラーチュートリアル ... |
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件を2025-07-02に公開中
