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4DWF	Crystal structure of a HLA-B associated transcript 3 (BAT3) from Homo sapiens at 1.80 A resolution 分子名称: HLA-B-associated transcript 3, SULFATE ION 著者 Joint Center for Structural Genomics (JCSG), Partnership for T-Cell Biology (TCELL) 登録日 2012-02-24 公開日 2012-03-28 最終更新日 2023-02-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Crystal structure of a HLA-B associated transcript 3 (BAT3) from Homo sapiens at 1.80 A resolution To be published
1M94	Solution Structure of the Yeast Ubiquitin-Like Modifier Protein Hub1 分子名称: Protein YNR032c-a 著者 Ramelot, T.A, Cort, J.R, Yee, A.A, Semesi, A, Edwards, A.M, Arrowsmith, C.H, Kennedy, M.A, Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) 登録日 2002-07-26 公開日 2002-12-11 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution Structure of the Yeast Ubiquitin-Like Modifier Protein Hub1 J.STRUCT.FUNCT.GENOM., 4, 2003
1MG8	NMR structure of ubiquitin-like domain in murine Parkin 分子名称: Parkin 著者 Tashiro, M, Okubo, S, Shimotakahara, S, Hatanaka, H, Yasuda, H, Kainosho, M, Yokoyama, S, Shindo, H, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 登録日 2002-08-15 公開日 2003-04-08 最終更新日 2024-05-29 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 NMR structure of ubiquitin-like domain in PARKIN: Gene product of familial Parkinson's disease. J.Biomol.NMR, 25, 2003
5EMZ	Crystal structure of K48-linked diubiquitin with F45W mutation in the proximal unit 分子名称: Polyubiquitin-B, SULFATE ION 著者 Nakasone, M.A, Paukstelis, P.J, Fushman, D. 登録日 2015-11-07 公開日 2016-11-16 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.66 Å) 主引用文献 Structural characterization and practical fluorescence applications of the F45W ubiquitin mutant To Be Published
6KNA	Viral Ubiquitin from Autographa californica Nucleo Polyhedrosis Virus 分子名称: Viral ubiquitin 著者 Negi, H, Reddy, P.P, Das, R. 登録日 2019-08-05 公開日 2020-06-17 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 A novel polyubiquitin chain linkage formed by viral Ubiquitin is resistant to host deubiquitinating enzymes. Biochem.J., 477, 2020
4WZP	Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 分子名称: SULFATE ION, ubiquitin 著者 Wauer, T, Wagstaff, J, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2014-11-20 公開日 2015-01-14 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Ubiquitin Ser65 phosphorylation affects ubiquitin structure, chain assembly and hydrolysis. Embo J., 34, 2015
6KOX	Relaxed state of S65/T66 double-phosphorylated ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Dong, X, Tang, C. 登録日 2019-08-13 公開日 2019-08-28 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Ubiquitin is double-phosphorylated by PINK1 for enhanced pH-sensitivity of conformational switch. Protein Cell, 10, 2019
6OQ1	Crystal Structure of Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin 分子名称: Ubiquitin 著者 Boughton, A.J, Fushman, D. 登録日 2019-04-25 公開日 2019-10-23 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Branching via K11 and K48 Bestows Ubiquitin Chains with a Unique Interdomain Interface and Enhanced Affinity for Proteasomal Subunit Rpn1. Structure, 28, 2020
7NPO	Branched K48-K63-Ub3 分子名称: GLYCEROL, Polyubiquitin-B 著者 Lange, S.M, Kwasna, D, Kulathu, Y. 登録日 2021-02-27 公開日 2022-08-10 最終更新日 2024-07-31 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 VCP/p97-associated proteins are binders and debranching enzymes of K48-K63-branched ubiquitin chains. Nat.Struct.Mol.Biol., 2024
1IYF	Solution structure of ubiquitin-like domain of human parkin 分子名称: parkin 著者 Sakata, E, Yamaguchi, Y, Kurimoto, E, Kikuchi, J, Yokoyama, S, Kawahara, H, Yokosawa, H, Hattori, N, Mizuno, Y, Tanaka, K, Kato, K, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 登録日 2002-08-13 公開日 2003-03-25 最終更新日 2023-12-27 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Parkin binds the Rpn10 subunit of 26S proteasomes through its ubiquitin-like domain EMBO REP., 4, 2003
1J8C	Solution Structure of the Ubiquitin-like Domain of hPLIC-2 分子名称: ubiquitin-like protein hPLIC-2 著者 Walters, K.J, Kleijnen, M.F, Goh, A.M, Wagner, G, Howley, P.M. 登録日 2001-05-21 公開日 2002-03-20 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural studies of the interaction between ubiquitin family proteins and proteasome subunit S5a. Biochemistry, 41, 2002
1F9J	STRUCTURE OF A NEW CRYSTAL FORM OF TETRAUBIQUITIN 分子名称: TETRAUBIQUITIN 著者 Phillips, C.L, Thrower, J, Pickart, C.M, Hill, C.P. 登録日 2000-07-10 公開日 2001-02-07 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Structure of a new crystal form of tetraubiquitin. Acta Crystallogr.,Sect.D, 57, 2001
1C3T	ROTAMER STRAIN AS A DETERMINANT OF PROTEIN STRUCTURAL SPECIFICITY 分子名称: PROTEIN (1D8 UBIQUITIN) 著者 Lazar, G.A, Johnson, E.C, Desjarlais, J.R, Handel, T.M. 登録日 1999-07-28 公開日 1999-08-20 最終更新日 2024-04-10 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Rotamer strain as a determinant of protein structural specificity. Protein Sci., 8, 1999
1AAR	STRUCTURE OF A DIUBIQUITIN CONJUGATE AND A MODEL FOR INTERACTION WITH UBIQUITIN CONJUGATING ENZYME (E2) 分子名称: DI-UBIQUITIN 著者 Cook, W.J, Jeffrey, L.C, Carson, M, Chen, Z, Pickart, C.M. 登録日 1992-04-17 公開日 1993-10-31 最終更新日 2024-06-05 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Structure of a diubiquitin conjugate and a model for interaction with ubiquitin conjugating enzyme (E2). J.Biol.Chem., 267, 1992
1GJZ	Solution structure of a dimeric N-terminal fragment of human ubiquitin 分子名称: UBIQUITIN 著者 Bolton, D, Evans, P.A, Stott, K, Broadhurst, R.W. 登録日 2001-08-06 公開日 2001-12-13 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure and Properties of a Dimeric N-Terminal Fragment of Human Ubiquitin. J.Mol.Biol., 314, 2001
1BT0	STRUCTURE OF UBIQUITIN-LIKE PROTEIN, RUB1 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, PROTEIN (UBIQUITIN-LIKE PROTEIN 7, RUB1), ... 著者 Delacruz, W.P, Fisher, A.J. 登録日 1998-09-02 公開日 1998-12-30 最終更新日 2023-08-09 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 The rub family of ubiquitin-like proteins. Crystal structure of Arabidopsis rub1 and expression of multiple rubs in Arabidopsis. J.Biol.Chem., 273, 1998
1D3Z	UBIQUITIN NMR STRUCTURE 分子名称: PROTEIN (UBIQUITIN) 著者 Cornilescu, G, Marquardt, J.L, Ottiger, M, Bax, A. 登録日 1999-10-01 公開日 1999-10-14 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Validation of Protein Structure from Anisotropic Carbonyl Chemical Shifts in a Dilute Liquid Crystalline Phase J.Am.Chem.Soc., 120, 1998
1G6J	STRUCTURE OF RECOMBINANT HUMAN UBIQUITIN IN AOT REVERSE MICELLES 分子名称: UBIQUITIN 著者 Babu, C.R, Flynn, P.F, Wand, A.J. 登録日 2000-11-06 公開日 2001-03-28 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Validation of protein structure from preparations of encapsulated proteins dissolved in low viscosity fluids. J.Am.Chem.Soc., 123, 2001
1L2N	Smt3 Solution Structure 分子名称: Ubiquitin-like protein SMT3 著者 Sheng, W, Liao, X. 登録日 2002-02-22 公開日 2002-03-06 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of a yeast ubiquitin-like protein Smt3: the role of structurally less defined sequences in protein-protein recognitions. Protein Sci., 11, 2002
5OHL	K6-specific affimer bound to K6 diUb 分子名称: GLYCEROL, K6-specific affimer, POLYETHYLENE GLYCOL (N=34), ... 著者 Michel, M.A, Komander, D. 登録日 2017-07-17 公開日 2017-10-04 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Ubiquitin Linkage-Specific Affimers Reveal Insights into K6-Linked Ubiquitin Signaling. Mol. Cell, 68, 2017
5OHV	K33-specific affimer bound to K33 diUb 分子名称: GLYCEROL, K33-specific affimer, SULFATE ION, ... 著者 Michel, M.A, Komander, D. 登録日 2017-07-18 公開日 2017-10-04 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.801 Å) 主引用文献 Ubiquitin Linkage-Specific Affimers Reveal Insights into K6-Linked Ubiquitin Signaling. Mol. Cell, 68, 2017
5OXI	C-terminally retracted ubiquitin L67S mutant 分子名称: SULFATE ION, Ubiquitin L67S mutant 著者 Gladkova, C.G, Schubert, A.F, Wagstaff, J.L, Pruneda, J.N, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2017-09-06 公開日 2017-11-22 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.63 Å) 主引用文献 An invisible ubiquitin conformation is required for efficient phosphorylation by PINK1. EMBO J., 36, 2017
5OXH	C-terminally retracted ubiquitin T66V/L67N mutant 分子名称: SULFATE ION, Ubiquitin T66V/L67N mutant 著者 Gladkova, C, Schubert, A.F, Wagstaff, J.L, Pruneda, J.P, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2017-09-06 公開日 2017-11-22 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.601 Å) 主引用文献 An invisible ubiquitin conformation is required for efficient phosphorylation by PINK1. EMBO J., 36, 2017
5OHM	K33-specific affimer bound to K33 diUb 分子名称: K33-specific affimer, POLYETHYLENE GLYCOL (N=34), Polyubiquitin-C 著者 Michel, M.A, Komander, D. 登録日 2017-07-17 公開日 2017-10-04 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.8 Å) 主引用文献 Ubiquitin Linkage-Specific Affimers Reveal Insights into K6-Linked Ubiquitin Signaling. Mol. Cell, 68, 2017
4S22	Crystal structure of K29 linked di-Ubiquitin 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, GLYCEROL, IODIDE ION, ... 著者 Kristariyanto, Y.A, Abdul Rehman, S.A, Campbell, D.G, Morrice, N.A, Johnson, C, Toth, R, Kulathu, Y. 登録日 2015-01-17 公開日 2015-04-08 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 K29-selective ubiquitin binding domain reveals structural basis of specificity and heterotypic nature of k29 polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015

 

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