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3EUS	The crystal structure of the DNA binding protein from Silicibacter pomeroyi 分子名称: DNA-binding protein 著者 Zhang, R, Li, H, Freeman, L, Joachimiak, A, Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) 登録日 2008-10-10 公開日 2008-11-25 最終更新日 2023-12-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 The crystal structure of the DNA binding protein from Silicibacter pomeroyi To be Published
3ZHI	N-terminal domain of the CI repressor from bacteriophage TP901-1 分子名称: CI 著者 Frandsen, K.H, Rasmussen, K.K, Poulsen, J.N, Lo Leggio, L. 登録日 2012-12-21 公開日 2013-12-25 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 Binding of the N-Terminal Domain of the Lactococcal Bacteriophage Tp901-1 Ci Repressor to its Target DNA: A Crystallography, Small Angle Scattering, and Nuclear Magnetic Resonance Study. Biochemistry, 52, 2013
3FYA	Crystal Structure of an R35A mutant of the Restriction-Modification Controller Protein C.Esp1396I 分子名称: Regulatory protein 著者 Ball, N.J, McGeehan, J.E, Thresh, S.J, Streeter, S.D, Kneale, G.G. 登録日 2009-01-22 公開日 2009-08-25 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Structure of the restriction-modification controller protein C.Esp1396I. Acta Crystallogr.,Sect.D, 65, 2009
3ZHM	N-terminal domain of the CI repressor from bacteriophage TP901-1 in complex with the OL2 operator half-site 分子名称: 5'-D(*AP*CP*GP*TP*GP*AP*AP*CP*TP*TP*GP*CP*AP*CP *TP*TP*GP*A)-3', 5'-D(*AP*GP*TP*TP*CP*AP*CP*GP*TP*TP*CP*AP*AP*GP *TP*GP*CP*A)-3', CI 著者 Frandsen, K.H, Rasmussen, K.K, Poulsen, J.N, Lo Leggio, L. 登録日 2012-12-22 公開日 2013-12-25 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Binding of the N-Terminal Domain of the Lactococcal Bacteriophage Tp901-1 Ci Repressor to its Target DNA: A Crystallography, Small Angle Scattering, and Nuclear Magnetic Resonance Study. Biochemistry, 52, 2013
3G5G	Crystal Structure of the Wild-Type Restriction-Modification Controller Protein C.Esp1396I 分子名称: Regulatory protein 著者 Ball, N.J, McGeehan, J.E, Thresh, S.J, Streeter, S.D, Kneale, G.G. 登録日 2009-02-05 公開日 2009-08-25 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structure of the restriction-modification controller protein C.Esp1396I. Acta Crystallogr.,Sect.D, 65, 2009
6IRP	Crystal structure of HigA from Shigella flexneri 分子名称: Antitoxin HigA 著者 Yoon, W.S, Seok, S.H, Seo, M.D. 登録日 2018-11-14 公開日 2019-09-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.954 Å) 主引用文献 Structural changes of antitoxin HigA from Shigella flexneri by binding of its cognate toxin HigB. Int.J.Biol.Macromol., 130, 2019
6JPI	Crystal structure of PA4674 in complex with its operator DNA (28bp) from Pseudomonas aeruginosa 分子名称: DNA (28-MER), HTH cro/C1-type domain-containing protein 著者 Liu, Y, Gao, Z, Zhang, H, Dong, Y. 登録日 2019-03-27 公開日 2020-04-01 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.143 Å) 主引用文献 Crystal structure of PA4674 in complex with its operator DNA (28bp) from Pseudomonas aeruginosa To Be Published
6JQ4	HIGA Escherichia coli-K12 分子名称: Antitoxin HigA 著者 She, Z, Xu, B.S. 登録日 2019-03-28 公開日 2019-05-01 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Conformational changes of antitoxin HigA from Escherichia coli str. K-12 upon binding of its cognate toxin HigB reveal a new regulation mechanism in toxin-antitoxin systems. Biochem.Biophys.Res.Commun., 514, 2019
6JQ1	Crystal Structure of DdrO from Deinococcus geothermalis 分子名称: LITHIUM ION, Transcriptional regulator, XRE family 著者 Lu, H, Hua, Y, Zhao, Y. 登録日 2019-03-28 公開日 2019-08-28 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Structure and DNA damage-dependent derepression mechanism for the XRE family member DG-DdrO. Nucleic Acids Res., 47, 2019
6LB3	Crystal structure of PA4674 in complex with its operator DNA (18bp) from Pseudomonas aeruginosa 分子名称: DNA (5'-D(P*AP*CP*CP*CP*TP*TP*AP*AP*CP*GP*TP*TP*AP*AP*GP*CP*GP*T)-3'), DNA (5'-D(P*AP*CP*GP*CP*TP*TP*AP*AP*CP*GP*TP*TP*AP*AP*GP*GP*GP*T)-3'), HTH cro/C1-type domain-containing protein, ... 著者 Liu, Y, Zhang, H, Gao, Z, Dong, Y. 登録日 2019-11-13 公開日 2020-11-18 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.497 Å) 主引用文献 Crystal structure of PA4674 in complex with its operator DNA (18bp) from Pseudomonas aeruginosa To Be Published
6LTY	DNA bound antitoxin HigA3 分子名称: DNA (5'-D(P*CP*CP*AP*CP*GP*AP*GP*AP*TP*AP*TP*AP*AP*CP*CP*TP*AP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(P*CP*TP*CP*TP*AP*GP*GP*TP*TP*AP*TP*AP*TP*CP*TP*CP*GP*TP*GP*G)-3'), Putative antitoxin HigA3 著者 Park, J.Y, Lee, B.J. 登録日 2020-01-23 公開日 2020-07-15 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.28 Å) 主引用文献 Induced DNA bending by unique dimerization of HigA antitoxin. Iucrj, 7, 2020
6LTZ	Induced DNA bending by unique dimerization of HigA antitoxin 分子名称: 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID, DI(HYDROXYETHYL)ETHER, GLYCEROL, ... 著者 Park, J.Y, Lee, B.J. 登録日 2020-01-23 公開日 2020-07-15 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.973 Å) 主引用文献 Induced DNA bending by unique dimerization of HigA antitoxin. Iucrj, 7, 2020
4I6R	High Resolution Crystal Structure of the Wild-Type Restriction-Modification Controller Protein C.Esp1396I (Triclinic form) 分子名称: GLYCEROL, Regulatory protein, SULFATE ION 著者 Martin, R.N.A, McGeehan, J.E, Kneale, G.G. 登録日 2012-11-30 公開日 2013-11-13 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.38 Å) 主引用文献 Structural and Mutagenic Analysis of the RM Controller Protein C.Esp1396I. Plos One, 9, 2014
4IA8	Crystal Structure of a Y37A mutant of the Restriction-Modification Controller Protein C.Esp1396I 分子名称: Regulatory protein, SULFATE ION 著者 Martin, R.N.A, McGeehan, J.E, Kneale, G.G. 登録日 2012-12-06 公開日 2013-12-11 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Structural and Mutagenic Analysis of the RM Controller Protein C.Esp1396I. Plos One, 9, 2014
4I6T	Crystal Structure of a T36A mutant of the Restriction-Modification Controller Protein C.Esp1396I 分子名称: MALONATE ION, Regulatory protein 著者 Martin, R.N.A, McGeehan, J.E, Kneale, G.G. 登録日 2012-11-30 公開日 2013-11-13 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Structural and Mutagenic Analysis of the RM Controller Protein C.Esp1396I. Plos One, 9, 2014
4I6U	Crystal Structure of a Y37F mutant of the Restriction-Modification Controller Protein C.Esp1396I 分子名称: ACETATE ION, DI(HYDROXYETHYL)ETHER, GLYCEROL, ... 著者 Martin, R.N.A, McGeehan, J.E, Kneale, G.G. 登録日 2012-11-30 公開日 2013-11-13 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.97 Å) 主引用文献 Structural and Mutagenic Analysis of the RM Controller Protein C.Esp1396I. Plos One, 9, 2014
4I8T	C.Esp1396I bound to a 19 base pair DNA duplex 分子名称: DNA (5'-D(P*TP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*TP*TP*AP*TP*AP*GP*TP*CP*AP*AP*CP*A)-3'), DNA (5'-D(P*TP*GP*TP*TP*GP*AP*CP*TP*AP*TP*AP*AP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*A)-3'), Regulatory protein 著者 Martin, R.N.A, McGeehan, J.E, Kneale, G.G. 登録日 2012-12-04 公開日 2013-09-11 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Structural analysis of DNA-protein complexes regulating the restriction-modification system Esp1396I. Acta Crystallogr.,Sect.F, 69, 2013
4IVZ	A Y37F mutant of C.Esp1396I bound to its highest affinity operator site OM 分子名称: DNA (5'-D(*AP*TP*GP*TP*AP*GP*AP*CP*TP*AP*TP*AP*GP*TP*CP*GP*AP*CP*A)-3'), DNA (5'-D(*TP*TP*GP*TP*CP*GP*AP*CP*TP*AP*TP*AP*GP*TP*CP*TP*AP*CP*A)-3'), Regulatory protein 著者 Martin, R.N.A, McGeehan, J.E, Kneale, G.G. 登録日 2013-01-23 公開日 2014-01-29 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) 主引用文献 Structural and Mutagenic Analysis of the RM Controller Protein C.Esp1396I. Plos One, 9, 2014
4IWR	C.Esp1396I bound to a 25 base pair operator site 分子名称: DNA (25-MER), Regulatory protein 著者 Martin, R.N.A, McGeehan, J.E, Ball, N.J, Streeter, S.D, Thresh, S.-J, Kneale, G.G. 登録日 2013-01-24 公開日 2013-09-11 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Structural analysis of DNA-protein complexes regulating the restriction-modification system Esp1396I. Acta Crystallogr.,Sect.F, 69, 2013
4YBA	The structure of the C.Kpn2I controller protein 分子名称: GLYCEROL, Regulatory protein C 著者 Shevtsov, M.B, Martin, R.N, Swiderska, A, McGeehan, G.E, Kneale, G.G. 登録日 2015-02-18 公開日 2016-03-02 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 The structure of the C.kpn2I controller protein To Be Published
4YG1	HipB-O1-O2 complex/P21212 crystal form 分子名称: Antitoxin HipB, DNA (48-MER) 著者 Schumacher, M.A. 登録日 2015-02-25 公開日 2015-07-29 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.25 Å) 主引用文献 HipBA-promoter structures reveal the basis of heritable multidrug tolerance. Nature, 524, 2015
4YG4	HipB-O1-O1* complex 分子名称: Antitoxin HipB, DNA (28-MER), DNA (5'-D(*AP*TP*AP*TP*CP*CP*CP*CP*TP*TP*AP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*TP*AP*A)-3') 著者 Schumacher, M.A. 登録日 2015-02-25 公開日 2015-07-29 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.5 Å) 主引用文献 HipBA-promoter structures reveal the basis of heritable multidrug tolerance. Nature, 524, 2015
4Z5H	HipB(S29A)-O2 20mer complex 分子名称: Antitoxin HipB, DNA (5'-D(*TP*TP*AP*TP*CP*CP*TP*CP*AP*CP*TP*AP*AP*AP*GP*GP*AP*TP*AP*A)-3') 著者 Min, J, Brennan, R.G, Schumacher, M.A. 登録日 2015-04-02 公開日 2016-07-06 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Molecular mechanism on hipBA gene regulation. To be published
4Z5C	HipB-O3 21mer complex 分子名称: Antitoxin HipB, DNA (5'-D(*TP*TP*TP*AP*TP*CP*CP*CP*GP*TP*AP*GP*AP*GP*CP*GP*GP*AP*TP*AP*A)-3'), DNA (5'-D(*TP*TP*TP*AP*TP*CP*CP*GP*CP*TP*CP*TP*AP*CP*GP*GP*GP*AP*TP*A)-3') 著者 Min, J, Brennan, R.G, Schumacher, M.A. 登録日 2015-04-02 公開日 2016-07-06 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Molecular mechanism on hipBA gene regulation. To be published
4Z59	HipB-O4 20mer complex 分子名称: Antitoxin HipB, DNA (5'-D(*TP*TP*AP*TP*CP*CP*GP*CP*GP*AP*TP*CP*GP*CP*GP*GP*AP*TP*AP*A)-3') 著者 Min, J, Brennan, R.G, Schumacher, M.A. 登録日 2015-04-02 公開日 2016-07-06 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Molecular mechanism on hipBA gene regulation. To be published

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