PDB: 45953 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

1VTB	THE HEXAGONAL CRYSTAL STRUCTURE OF THE A-DNA OCTAMER D(GTGTACAC) AND ITS COMPARISON WITH THE TETRAGONAL STRUCTURE CORRELATED VARIATIONS IN HELICAL PARAMETERS 分子名称: DNA (5'-D(*GP*TP*GP*TP*AP*CP*AP*C)-3') 著者 Jain, S.C, Zon, G, Sundaralingam, M. 登録日 1991-05-28 公開日 2011-07-13 最終更新日 2023-12-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 The Hexagonal Crystal Structure of the A-DNA Octamer d(GTGTACAC) and Its Comparison with the Tetragonal Structure Correlated Variations in Helical Parameters Biochemistry, 30, 1991
7PEY	Nucleosome 3 of the 4x177 nucleosome array containing H1 分子名称: DNA (202-MER), DNA (203-MER), Histone H2A type 1-B/E, ... 著者 Dombrowski, M, Cramer, P. 登録日 2021-08-11 公開日 2022-08-03 最終更新日 2024-07-17 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.5 Å) 主引用文献 Histone H1 binding to nucleosome arrays depends on linker DNA length and trajectory. Nat.Struct.Mol.Biol., 29, 2022
7PF4	Nucleosome 3 of the 4x187 nucleosome array containing H1 分子名称: DNA (167-MER), Histone H2A type 1-B/E, Histone H2B type 1-K, ... 著者 Dombrowski, M, Cramer, P. 登録日 2021-08-11 公開日 2022-08-03 最終更新日 2024-07-17 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4 Å) 主引用文献 Histone H1 binding to nucleosome arrays depends on linker DNA length and trajectory. Nat.Struct.Mol.Biol., 29, 2022
1TF6	CO-CRYSTAL STRUCTURE OF XENOPUS TFIIIA ZINC FINGER DOMAIN BOUND TO THE 5S RIBOSOMAL RNA GENE INTERNAL CONTROL REGION 分子名称: DNA (5'-D(*AP*CP*GP*GP*GP*CP*CP*TP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*TP*AP*C P*CP*TP*GP*GP*AP* TP*GP*GP*GP*AP*GP*AP*CP*C)-3'), DNA (5'-D(*TP*GP*GP*TP*CP*TP*CP*CP*CP*AP*TP*CP*CP*AP*GP*GP*T P*AP*CP*TP*AP*AP* CP*CP*AP*GP*GP*CP*CP*CP*G)-3'), PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR IIIA), ... 著者 Nolte, R.T, Conlin, R.M, Harrison, S.C, Brown, R.S. 登録日 1998-03-02 公開日 1998-07-10 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) 主引用文献 Differing roles for zinc fingers in DNA recognition: structure of a six-finger transcription factor IIIA complex. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 95, 1998
8DRH	HIGH RESOLUTION NMR STRUCTURE OF THE D(GCGTCAGG)R(CCUGACGC) HYBRID, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 分子名称: DNA (5'-D(*GP*CP*GP*TP*CP*AP*GP*G)-3'), RNA (5'-R(*CP*CP*UP*GP*AP*CP*GP*C)-3') 著者 Bachelin, M, Hessler, G, Kurz, G, Hacia, J.G, Dervan, P.B, Kessler, H. 登録日 1997-10-13 公開日 1998-05-27 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of a Stereoregular Phosphorothioate DNA/RNA Duplex Nat.Struct.Biol., 5, 1998
3PT9	Crystal structure of mouse DNMT1(731-1602) in the free state 分子名称: DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE, ZINC ION 著者 Song, J, Patel, D.J. 登録日 2010-12-02 公開日 2010-12-29 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structure of DNMT1-DNA complex reveals a role for autoinhibition in maintenance DNA methylation. Science, 331, 2011
7VG8	TYLCV Rep-DNA 分子名称: DNA (5'-((DT)P*(DA)P*(DA)P*(DT)P*(DA)P*(DT)P*(DT)P*(DA)*(DC)P*)-3'), MANGANESE (II) ION, Replication-associated protein 著者 Zhang, S.Y, Wang, C.N. 登録日 2021-09-14 公開日 2022-09-21 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.04 Å) 主引用文献 structure of TYLCV Rep complexed with ssDNA To Be Published
3I0M	Structure of the S. pombe Nbs1 FHA/BRCT-repeat domain 分子名称: DNA repair and telomere maintenance protein nbs1, GLYCEROL 著者 Clapperton, J.A, Lloyd, J, Chapman, J.R, Jackson, S.P, Smerdon, S.J. 登録日 2009-06-25 公開日 2009-10-13 最終更新日 2012-05-02 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 A supramodular FHA/BRCT-repeat architecture mediates Nbs1 adaptor function in response to DNA damage Cell(Cambridge,Mass.), 139, 2009
7PEW	Nucleosome 1 of the 4x177 nucleosome array containing H1 分子名称: DNA (176-MER), Histone H2A type 1-B/E, Histone H2B type 1-K, ... 著者 Dombrowski, M, Cramer, P. 登録日 2021-08-11 公開日 2022-08-03 最終更新日 2024-07-17 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.6 Å) 主引用文献 Histone H1 binding to nucleosome arrays depends on linker DNA length and trajectory. Nat.Struct.Mol.Biol., 29, 2022
7PEV	Nucleosome stack of the 4x177 nucleosome array containing H1 分子名称: DNA (520-MER), Histone H2A type 1-B/E, Histone H2B type 1-K, ... 著者 Dombrowski, M, Cramer, P. 登録日 2021-08-11 公開日 2022-08-03 最終更新日 2024-07-17 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (6 Å) 主引用文献 Histone H1 binding to nucleosome arrays depends on linker DNA length and trajectory. Nat.Struct.Mol.Biol., 29, 2022
7PFF	Nucleosome 3 of the 4x197 nucleosome array containing H1 分子名称: DNA (167-MER), Histone H2A type 1-B/E, Histone H2B type 1-K, ... 著者 Dombrowski, M, Cramer, P. 登録日 2021-08-11 公開日 2022-08-03 最終更新日 2024-07-17 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.3 Å) 主引用文献 Histone H1 binding to nucleosome arrays depends on linker DNA length and trajectory. Nat.Struct.Mol.Biol., 29, 2022
1YSE	Solution structure of the MAR-binding domain of SATB1 分子名称: DNA-binding protein SATB1 著者 Yamasaki, K, Yamaguchi, H. 登録日 2005-02-08 公開日 2006-01-03 最終更新日 2024-05-29 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution Structure and DNA-binding Mode of the Matrix Attachment Region-binding Domain of the Transcription Factor SATB1 That Regulates the T-cell Maturation J.Biol.Chem., 281, 2006
6KCO	Shuguo PWWP in complex with ssDNA 分子名称: DNA (5'-D(*TP*CP*CP*CP*T)-3'), LD23804p 著者 Liu, Y.C, Huang, Y. 登録日 2019-06-28 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Shuguo PWWP in complex with ssDNA To Be Published
3I0N	Structure of the S. pombe Nbs1 FHA/BRCT-repeat domain 分子名称: DNA repair and telomere maintenance protein nbs1, GLYCEROL 著者 Clapperton, J.A, Lloyd, J, Chapman, J.R, Jackson, S.P, Smerdon, S.J. 登録日 2009-06-25 公開日 2009-10-13 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 A supramodular FHA/BRCT-repeat architecture mediates Nbs1 adaptor function in response to DNA damage Cell(Cambridge,Mass.), 139, 2009
461D	A "HYDRAT-ION SPINE" IN A B-DNA MINOR GROOVE 分子名称: DNA (5'-D(*CP*GP*CP*GP*AP*AP*(TAF)P*TP*CP*GP*CP*G)-3'), MAGNESIUM ION, RUBIDIUM ION 著者 Tereshko, V, Minasov, G, Egli, M. 登録日 1999-03-12 公開日 1999-04-08 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.5 Å) 主引用文献 A "Hydrat-Ion Spine" in a B-DNA minor groove J.Am.Chem.Soc., 121, 1999
414D	5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*CP*CP*C)-3' 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*CP*CP*C)-3') 著者 Savitha, G, Viswamitra, M.A. 登録日 1998-07-13 公開日 1999-06-14 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 An A-DNA structure with two independent duplexes in the asymmetric unit. Acta Crystallogr.,Sect.D, 55, 1999
460D	A "HYDRAT-ION SPINE" IN A B-DNA MINOR GROOVE 分子名称: DNA (5'-D(*CP*GP*CP*GP*AP*AP*(TAF)P*TP*CP*GP*CP*G)-3'), MAGNESIUM ION, RUBIDIUM ION 著者 Tereshko, V, Minasov, G, Egli, M. 登録日 1999-03-12 公開日 1999-04-08 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.2 Å) 主引用文献 A "Hydrat-Ion Spine" in a B-DNA minor groove J.Am.Chem.Soc., 121, 1999
6KCP	Shuguo PWWP in complex with ssDNA 分子名称: DNA (5'-D(P*TP*TP*TP*TP*T)-3'), LD23804p 著者 Liu, Y.C, Huang, Y. 登録日 2019-06-28 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Shuguo PWWP in complex with ssDNA To Be Published
4A1F	Crystal structure of C-terminal domain of Helicobacter pylori DnaB Helicase 分子名称: CITRATE ANION, REPLICATIVE DNA HELICASE 著者 Stelter, M, Kapp, U, Timmins, J, Terradot, L. 登録日 2011-09-14 公開日 2012-03-21 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Architecture of a Dodecameric Bacterial Replicative Helicase. Structure, 20, 2012
6A27	Crystal structure of PprA W183R mutant form 1 分子名称: DNA repair protein PprA, GLYCEROL, SULFATE ION 著者 Adachi, M, Shibazaki, C, Shimizu, R, Arai, S, Satoh, K, Narumi, I, Kuroki, R. 登録日 2018-06-09 公開日 2018-12-26 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.353 Å) 主引用文献 Extended structure of pleiotropic DNA repair-promoting protein PprA from Deinococcus radiodurans. FASEB J., 33, 2019
6A29	Crystal structure of PprA A139R mutant 分子名称: DNA repair protein PprA 著者 Adachi, M, Shibazaki, C, Shimizu, R, Arai, S, Satoh, K, Narumi, I, Kuroki, R. 登録日 2018-06-09 公開日 2018-12-26 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.399 Å) 主引用文献 Extended structure of pleiotropic DNA repair-promoting protein PprA from Deinococcus radiodurans. FASEB J., 33, 2019
5I6Q	Crystal structure of color device state B 分子名称: DNA (26-MER), DNA (5'-D(*AP*CP*AP*GP*TP*CP*GP*TP*GP*GP*TP*AP*TP*C)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*GP*AP*TP*AP*CP*CP*TP*GP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*AP*CP*G)-3'), ... 著者 Hao, Y, Birktoft, J, Seeman, N.C. 登録日 2016-02-16 公開日 2017-01-18 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (4.912 Å) 主引用文献 A device that operates within a self-assembled 3D DNA crystal. Nat Chem, 9, 2017
5I6T	Crystal structure of color device state C 分子名称: DNA (26-MER), DNA (5'-D(*AP*CP*AP*GP*TP*CP*GP*TP*GP*GP*TP*AP*TP*C)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*GP*AP*TP*AP*CP*CP*TP*GP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*AP*CP*G)-3'), ... 著者 Hao, Y, Birktoft, J, Seeman, N.C. 登録日 2016-02-16 公開日 2017-01-18 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (5.283 Å) 主引用文献 A device that operates within a self-assembled 3D DNA crystal. Nat Chem, 9, 2017
8CUC	Crystal structure analysis of SALL4 zinc finger domain in complex with DNA 分子名称: DNA (5'-D(P*CP*GP*AP*AP*AP*TP*AP*TP*TP*AP*GP*C)-3'), DNA (5'-D(P*GP*CP*TP*AP*AP*TP*AP*TP*TP*TP*CP*G)-3'), Sal-like protein 4, ... 著者 Seo, H.S, Dhe-Paganon, S. 登録日 2022-05-17 公開日 2023-05-24 最終更新日 2024-05-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.09 Å) 主引用文献 Crystal Structure Analysis of SALL4 Zinc Finger domain in complex with DNA To Be Published
3THW	Human MutSbeta complexed with an IDL of 4 bases (Loop4) and ADP 分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE, DNA Loop4 hairpin, DNA mismatch repair protein Msh2, ... 著者 Yang, W. 登録日 2011-08-19 公開日 2011-12-21 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.09 Å) 主引用文献 Mechanism of mismatch recognition revealed by human MutSbeta bound to unpaired DNA loops Nat.Struct.Mol.Biol., 19, 2012

<238239240241242243244245246247248249250251252253>