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3DIQ	Crystallization of the Thermotoga maritima lysine riboswitch bound to homoarginine 分子名称: L-HOMOARGININE, PENTAETHYLENE GLYCOL, POTASSIUM ION, ... 著者 serganov, A.A. 登録日 2008-06-20 公開日 2008-09-16 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Structural insights into amino acid binding and gene control by a lysine riboswitch. Nature, 455, 2008
3GX3	Crystal structure of the T. tengcongensis SAM-I riboswitch variant U34C/A94G bound with SAH 分子名称: MAGNESIUM ION, POTASSIUM ION, RNA (94-MER), ... 著者 Montange, R.K, Batey, R.T. 登録日 2009-04-01 公開日 2010-01-12 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Discrimination between Closely Related Cellular Metabolites by the SAM-I Riboswitch. J.Mol.Biol., 396, 2010
3GX7	Crystal structure of the T. tengcongensis SAM-I riboswitch variant U34C/A94G mutant A6C/U7G/A87C/U88G bound with SAM 分子名称: MAGNESIUM ION, RNA (94-MER), S-ADENOSYLMETHIONINE 著者 Montange, R.K, Batey, R.T. 登録日 2009-04-01 公開日 2010-01-12 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.95 Å) 主引用文献 Discrimination between Closely Related Cellular Metabolites by the SAM-I Riboswitch. J.Mol.Biol., 396, 2010
3DIL	Crystal structure of the Thermotoga maritima lysine riboswitch bound to lysine 分子名称: ISOPROPYL ALCOHOL, LYSINE, MAGNESIUM ION, ... 著者 Serganov, A.A. 登録日 2008-06-20 公開日 2008-09-16 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Structural insights into amino acid binding and gene control by a lysine riboswitch. Nature, 455, 2008
3DIS	Crystallization of the Thermotoga maritima lysine riboswitch in free form 分子名称: ISOPROPYL ALCOHOL, RNA (174-MER), SODIUM ION 著者 Serganov, A.A. 登録日 2008-06-20 公開日 2008-09-16 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) 主引用文献 Structural insights into amino acid binding and gene control by a lysine riboswitch. Nature, 455, 2008
3DIZ	Crystallization of the Thermotoga maritima lysine riboswitch bound to lysine in the Absence of Mg2+ 分子名称: LYSINE, POTASSIUM ION, RNA (174-MER), ... 著者 Serganov, A.A. 登録日 2008-06-21 公開日 2008-09-16 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.85 Å) 主引用文献 Structural insights into amino acid binding and gene control by a lysine riboswitch. Nature, 455, 2008
3DIG	CRYSTAL STRUCTURE OF THE THERMOTOGA MARITIMA LYSINE RIBOSWITCH BOUND TO S-(2-aminoethyl)-L-cysteine 分子名称: ISOPROPYL ALCOHOL, L-THIALYSINE, POTASSIUM ION, ... 著者 Serganov, A.A. 登録日 2008-06-20 公開日 2008-09-16 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structural insights into amino acid binding and gene control by a lysine riboswitch. Nature, 455, 2008
3DIX	Crystallization of the Thermotoga maritima lysine riboswitch bound to lysine, K+ anomalous data 分子名称: LYSINE, POTASSIUM ION, RNA (174-MER), ... 著者 Serganov, A.A. 登録日 2008-06-21 公開日 2008-09-16 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Structural insights into amino acid binding and gene control by a lysine riboswitch. Nature, 455, 2008
3DIR	Crystallization of the Thermotoga maritima lysine riboswitch bound to N6-1-iminoethyl-L-Lysine 分子名称: N~6~-[(1Z)-ethanimidoyl]-L-lysine, POTASSIUM ION, RNA (174-MER), ... 著者 Serganov, A.A. 登録日 2008-06-20 公開日 2008-09-16 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Structural insights into amino acid binding and gene control by a lysine riboswitch. Nature, 455, 2008
3PDR	Crystal structure of manganese bound M-box RNA 分子名称: M-box Riboswitch RNA, MANGANESE (II) ION, POTASSIUM ION 著者 Ramesh, A, Winkler, W.C. 登録日 2010-10-23 公開日 2011-02-23 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.853 Å) 主引用文献 Insights into Metalloregulation by M-box Riboswitch RNAs via Structural Analysis of Manganese-Bound Complexes. J.Mol.Biol., 407, 2011
6UES	Apo SAM-IV Riboswitch 分子名称: RNA (119-MER) 著者 Zhang, K, Li, S, Kappel, K, Pintilie, G, Su, Z, Mou, T, Schmid, M, Das, R, Chiu, W. 登録日 2019-09-23 公開日 2019-12-18 最終更新日 2024-03-20 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.7 Å) 主引用文献 Cryo-EM structure of a 40 kDa SAM-IV riboswitch RNA at 3.7 angstrom resolution. Nat Commun, 10, 2019
6UET	SAM-bound SAM-IV riboswitch 分子名称: RNA (119-MER), S-ADENOSYLMETHIONINE 著者 Zhang, K, Li, S, Kappel, K, Pintilie, G, Su, Z, Mou, T, Schmid, M, Das, R, Chiu, W. 登録日 2019-09-23 公開日 2019-12-18 最終更新日 2024-03-20 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.1 Å) 主引用文献 Cryo-EM structure of a 40 kDa SAM-IV riboswitch RNA at 3.7 angstrom resolution. Nat Commun, 10, 2019
3DJ0	Crystallization of the Thermotoga maritima lysine riboswitch bound to L-4-oxalysine 分子名称: O-(2-aminoethyl)-L-serine, POTASSIUM ION, RNA (174-MER), ... 著者 Serganov, A.A. 登録日 2008-06-21 公開日 2008-09-16 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structural insights into amino acid binding and gene control by a lysine riboswitch. Nature, 455, 2008
3GX2	TteSAM-I riboswitch variant A94GU34C bound to sinefungin 分子名称: MAGNESIUM ION, RNA (94-MER), SINEFUNGIN 著者 Montange, R.K, Batey, R.T. 登録日 2009-04-01 公開日 2010-01-12 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Discrimination between Closely Related Cellular Metabolites by the SAM-I Riboswitch. J.Mol.Biol., 396, 2010
5C45	Selective Small Molecule Inhibition of the FMN Riboswitch 分子名称: (6M)-2-[(3S)-1-{[2-(methylamino)pyrimidin-5-yl]methyl}piperidin-3-yl]-6-(thiophen-2-yl)pyrimidin-4-ol, FMN Riboswitch, MAGNESIUM ION, ... 著者 Fischmann, T.O. 登録日 2015-06-17 公開日 2015-10-07 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.93 Å) 主引用文献 Selective small-molecule inhibition of an RNA structural element. Nature, 526, 2015
3DS7	Structure of an RNA-2'-deoxyguanosine complex 分子名称: 2'-DEOXY-GUANOSINE, 67-MER, ACETATE ION, ... 著者 Edwards, A.L, Batey, R.T. 登録日 2008-07-11 公開日 2009-02-17 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 A structural basis for the recognition of 2'-deoxyguanosine by the purine riboswitch. J.Mol.Biol., 385, 2009
5FK5	SAM-I riboswitch bearing the H. marismortui Kt-7 variant 3bn is AA 分子名称: BARIUM ION, POTASSIUM ION, S-ADENOSYLMETHIONINE, ... 著者 Huang, L, Lilley, D.M.J. 登録日 2015-10-14 公開日 2016-05-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.315 Å) 主引用文献 A Critical Base Pair in K-Turns Determines the Conformational Class Adopted, and Correlates with Biological Function. Nucleic Acids Res., 44, 2016
1Y26	A-riboswitch-adenine complex 分子名称: ADENINE, MAGNESIUM ION, Vibrio vulnificus A-riboswitch 著者 Serganov, A, Yuan, Y.R, Patel, D.J. 登録日 2004-11-20 公開日 2004-12-28 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Structural Basis for Discriminative Regulation of Gene Expression by Adenine- and Guanine-Sensing mRNAs Chem.Biol., 11, 2004
8UTA	yjdF riboswitch from R. gauvreauii in complex with proflavine bound to Fab BL3-6 S97N 分子名称: Fab BL3-6 S97N heavy chain, Fab BL3-6 S97N light chain, MAGNESIUM ION, ... 著者 Krochmal, D, Lewicka, A, Piccirilli, J.A. 登録日 2023-10-30 公開日 2024-04-10 最終更新日 2024-05-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.05 Å) 主引用文献 Structural basis for promiscuity in ligand recognition by yjdF riboswitch. Cell Discov, 10, 2024
8F3C	Cryo-EM consensus structure of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 分子名称: DNA (38-MER), DNA (39-MER), DNA-directed RNA polymerase subunit alpha, ... 著者 Porta, J.C, Chauvier, A, Deb, I, Ellinger, E, Frank, A.T, Meze, K, Ohi, M.D, Walter, N.G. 登録日 2022-11-09 公開日 2023-06-21 最終更新日 2023-07-26 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.4 Å) 主引用文献 Structural basis for control of bacterial RNA polymerase pausing by a riboswitch and its ligand. Nat.Struct.Mol.Biol., 30, 2023
5FKD	SAM-I riboswitch bearing the H. marismortui Kt-7 variant 3bn is UA 分子名称: BARIUM ION, POTASSIUM ION, S-ADENOSYLMETHIONINE, ... 著者 Huang, L, Lilley, D.M.J. 登録日 2015-10-15 公開日 2016-05-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 A Critical Base Pair in K-Turns Determines the Conformational Class Adopted, and Correlates with Biological Function. Nucleic Acids Res., 44, 2016
4FRN	Crystal structure of the cobalamin riboswitch regulatory element 分子名称: BARIUM ION, Cobalamin riboswitch aptamer domain, Hydroxocobalamin 著者 Reyes, F.E, Johnson, J.E, Polaski, J.T, Batey, R.T. 登録日 2012-06-26 公開日 2012-10-17 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.43 Å) 主引用文献 B12 cofactors directly stabilize an mRNA regulatory switch. Nature, 492, 2012
4FRG	Crystal structure of the cobalamin riboswitch aptamer domain 分子名称: Hydroxocobalamin, IRIDIUM (III) ION, MAGNESIUM ION, ... 著者 Reyes, F.E, Johnson, J.E, Polaski, J.T, Batey, R.T. 登録日 2012-06-26 公開日 2012-10-17 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.95 Å) 主引用文献 B12 cofactors directly stabilize an mRNA regulatory switch. Nature, 492, 2012
4GMA	Crystal structure of the adenosylcobalamin riboswitch 分子名称: Adenosylcobalamin, Adenosylcobalamin riboswitch 著者 Reyes, F.E, Johnson, J.E, Polaski, J.T, Batey, R.T. 登録日 2012-08-15 公開日 2012-10-17 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.94 Å) 主引用文献 B12 cofactors directly stabilize an mRNA regulatory switch. Nature, 492, 2012
4XNR	Vibrio Vulnificus Adenine Riboswitch Aptamer Domain, Synthesized by Position-selective Labeling of RNA (PLOR), in Complex with Adenine 分子名称: ADENINE, MAGNESIUM ION, Vibrio Vulnificus Adenine Riboswitch 著者 Zhang, J, Liu, Y, Wang, Y.-X, Ferre-D'Amare, A.R. 登録日 2015-01-16 公開日 2015-05-06 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.21 Å) 主引用文献 Synthesis and applications of RNAs with position-selective labelling and mosaic composition. Nature, 522, 2015

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