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6XE9	10S myosin II (smooth muscle) 分子名称: Myosin II heavy chain (smooth muscle), Myosin light chain 9, Myosin light chain smooth muscle isoform 著者 Tiwari, P, Craig, R, Padron, R. 登録日 2020-06-12 公開日 2020-12-02 最終更新日 2024-03-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.3 Å) 主引用文献 Cryo-EM structure of the inhibited (10S) form of myosin II. Nature, 588, 2020
7M7Q	Human DNA Pol eta S113A with dT-ended primer and dAMPNPP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-28 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.27 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M81	Human DNA Pol eta with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 100 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.05 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M82	Human DNA Pol eta with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 300 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.07 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M7R	Human DNA Pol eta S113A with rA-ended primer and dAMPNPP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-28 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.81 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M87	Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 230 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
6L6X	The structure of ScoE with substrate 分子名称: (3~{R})-3-(2-hydroxy-2-oxoethylamino)butanoic acid, D(-)-TARTARIC ACID, FE (II) ION, ... 著者 Chen, T.Y, Chen, J, Zhou, J, Chang, W. 登録日 2019-10-29 公開日 2020-03-04 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.18 Å) 主引用文献 Pathway from N-Alkylglycine to Alkylisonitrile Catalyzed by Iron(II) and 2-Oxoglutarate-Dependent Oxygenases. Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 59, 2020
6RIC	Structure of the core Vaccinia Virus DNA-dependent RNA polymerase complex 分子名称: DNA-dependent RNA polymerase subunit rpo132, DNA-dependent RNA polymerase subunit rpo147, DNA-dependent RNA polymerase subunit rpo18, ... 著者 Grimm, C, Hillen, H.S, Bedenk, K, Bartuli, J, Neyer, S, Zhang, Q, Huettenhofer, A, Erlacher, M, Dienemann, C, Schlosser, A, Urlaub, H, Boettcher, B, Szalay, A, Cramer, P, Fischer, U. 登録日 2019-04-23 公開日 2019-12-18 最終更新日 2024-10-16 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (2.8 Å) 主引用文献 Structural Basis of Poxvirus Transcription: Transcribing and Capping Vaccinia Complexes. Cell, 179, 2019
7M7N	Human DNA Pol eta with 2'-FA-ended primer and dAMPNPP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*(AF5))-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-28 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.31 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
6L7W	Crystal structure of Cet1 from Trypanosoma cruzi in complex with manganese ion. 分子名称: MANGANESE (II) ION, mRNA_triPase domain-containing protein 著者 Kuwabara, N, Ho, K. 登録日 2019-11-03 公開日 2020-06-03 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Crystal structures of the RNA triphosphatase fromTrypanosoma cruziprovide insights into how it recognizes the 5'-end of the RNA substrate. J.Biol.Chem., 295, 2020
7M85	Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 80 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*A)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
5VJE	Class II fructose-1,6-bisphosphate aldolase of Escherichia coli with D-glucitol 1,6-bisphosphate 分子名称: D-Glucitol-1,6-bisphosphate, Fructose-bisphosphate aldolase class 2, SODIUM ION 著者 Coincon, M, Sygusch, J. 登録日 2017-04-19 公開日 2018-04-11 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.65 Å) 主引用文献 Active site remodeling during the catalytic cycle in metal-dependent fructose-1,6-bisphosphate aldolases. J. Biol. Chem., 293, 2018
7M88	Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 300 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.66 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M7P	Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dAMPNPP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*A)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-28 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M7T	Human DNA Pol eta S113A with dT-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 0 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-28 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.46 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
6L86	The structure of SfaA 分子名称: (2S)-2-hydroxybutanedioic acid, D-MALATE, FE (II) ION, ... 著者 Chen, T.Y, Chen, J, Zhou, J, Chang, W. 登録日 2019-11-05 公開日 2020-03-04 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.23 Å) 主引用文献 Pathway from N-Alkylglycine to Alkylisonitrile Catalyzed by Iron(II) and 2-Oxoglutarate-Dependent Oxygenases. Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 59, 2020
7M7Y	Human DNA Pol eta with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 0 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*A)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
6XL1	crystal structure of cA4-activated Card1(D294N) 分子名称: 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID, Card1, MANGANESE (II) ION, ... 著者 Rostol, J, Xie, W, Patel, D.J, Marraffini, L. 登録日 2020-06-27 公開日 2020-12-30 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) 主引用文献 The Card1 nuclease provides defence during type III CRISPR immunity. Nature, 590, 2021
7M8B	Human DNA Pol eta S113A with rA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 140 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M84	Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 40 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*A)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.47 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M86	Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 140 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.55 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M8C	Human DNA Pol eta S113A with rA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 230 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M8D	Human DNA Pol eta S113A with rA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 300 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, DIPHOSPHATE, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.92 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
5VVR	Ternary complex of RNA Pol II, transcription scaffold and Rad26 分子名称: DNA (NTS), DNA (TS), DNA repair and recombination protein RAD26, ... 著者 Lahiri, I, Leschziner, A.E. 登録日 2017-05-19 公開日 2017-11-22 最終更新日 2024-03-13 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (5.8 Å) 主引用文献 Structural basis for the initiation of eukaryotic transcription-coupled DNA repair. Nature, 551, 2017
6LCR	Cryo-EM structure of Dnf1 from Chaetomium thermophilum in the E1-ATP state 分子名称: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, Cdc50, ... 著者 He, Y, Xu, J, Wu, X, Li, L. 登録日 2019-11-19 公開日 2020-04-29 最終更新日 2020-07-29 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.4 Å) 主引用文献 Structures of a P4-ATPase lipid flippase in lipid bilayers. Protein Cell, 11, 2020

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