8SYB
X-ray crystal structure of UDP-2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-glucuronic acid-2-epimerase from Thermus thermophilus strain HB27, D98N variant in the presence of UDP-2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-glucuronic acid and UDP-N-acetylglucosamine at pH 9
8SYB の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb8syb/pdb |
関連するPDBエントリー | 8SXV 8SXW 8SXY 8SY0 8SY9 8SYA |
分子名称 | UDP-2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-glucuronic acid-2-epimerase, (2~{S},3~{S},4~{R},5~{R},6~{R})-4,5-diacetamido-6-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxane-2-carboxylic acid, URIDINE-DIPHOSPHATE-N-ACETYLGLUCOSAMINE, ... (6 entities in total) |
機能のキーワード | lipopolysaccharide, o-antigen, 2-epimerase, isomerase |
由来する生物種 | Thermus thermophilus HB27 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 2 |
化学式量合計 | 86621.55 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Thoden, J.B.,McKnight, J.O.,Kroft, C.W.,Jast, J.D.T.,Holden, H.M. Structural analysis of a bacterial UDP-sugar 2-epimerase reveals the active site architecture before and after catalysis. J.Biol.Chem., 299:105200-105200, 2023 Cited by PubMed: 37660908DOI: 10.1016/j.jbc.2023.105200 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) |
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