8EYU
Structure of Beetroot dimer bound to DFAME
8EYU の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb8eyu/pdb |
分子名称 | RNA (49-MER), POTASSIUM ION, methyl (2E)-3-{(4Z)-4-[(3,5-difluoro-4-hydroxyphenyl)methylidene]-1-methyl-5-oxo-4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl}prop-2-enoate, ... (4 entities in total) |
機能のキーワード | rna, aptamer, fluorescence, turn-on, fluorogenic, fluorophore, g-quartet, g-quadruplex |
由来する生物種 | synthetic construct |
タンパク質・核酸の鎖数 | 2 |
化学式量合計 | 32887.04 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Passalacqua, L.F.M.,Starich, M.R.,Link, K.A.,Wu, J.,Knutson, J.R.,Tjandra, N.,Jaffrey, S.R.,Ferre-D'Amare, A.R. Co-crystal structures of the fluorogenic aptamer Beetroot show that close homology may not predict similar RNA architecture. Nat Commun, 14:2969-2969, 2023 Cited by PubMed: 37221204DOI: 10.1038/s41467-023-38683-3 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) |
構造検証レポート
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