7VQ0

Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86

7VQ0 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb7vq0/pdb
• 関連するPDBエントリー: 7VPY
• EMDBエントリー: 32078
• 分子名称: Spike glycoprotein, Neutralizing nanobody P86, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: spike, nanobody, vhh, viral protein, viral protein-immune system complex, viral protein/immune system
• 由来する生物種: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV, SARS-CoV-2); 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 6
• 化学式量合計: 473845.69

構造登録者

Maeda, R.,Fujita, J.,Konishi, Y.,Kazuma, Y.,Yamazaki, H.,Anzai, I.,Yamaguchi, K.,Kasai, K.,Nagata, K.,Yamaoka, Y.,Miyakawa, K.,Ryo, A.,Shirakawa, K.,Makino, F.,Matsuura, Y.,Inoue, T.,Imura, A.,Namba, K.,Takaori-Kondo, A. (登録日: 2021-10-18, 公開日: 2022-07-20)

• 主引用文献: Maeda, R.,Fujita, J.,Konishi, Y.,Kazuma, Y.,Yamazaki, H.,Anzai, I.,Watanabe, T.,Yamaguchi, K.,Kasai, K.,Nagata, K.,Yamaoka, Y.,Miyakawa, K.,Ryo, A.,Shirakawa, K.,Sato, K.,Makino, F.,Matsuura, Y.,Inoue, T.,Imura, A.,Namba, K.,Takaori-Kondo, A.; A panel of nanobodies recognizing conserved hidden clefts of all SARS-CoV-2 spike variants including Omicron.; Commun Biol, 5:669-669, 2022; PubMed: 35794202; DOI: 10.1038/s42003-022-03630-3

実験手法

ELECTRON MICROSCOPY (3.03 Å)