7QSH

23S ribosomal RNA Sarcin Ricin Loop 27-nt fragment containing a Xanthosine residue at position 2648

7QSH の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb7qsh/pdb
• 分子名称: 23S ribosomal RNA Sarcin Ricin Loop 27-nucleotide fragment, URIDINE, 9-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-3,4-bis(oxidanyl)-5-[[tris(oxidanyl)-$l^{5}-phosphanyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-2-oxidanyl-1~{H}-purin-6-one, ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: rna, modified base
• 由来する生物種: synthetic construct
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 9329.71

構造登録者

Ennifar, E.,Micura, R. (登録日: 2022-01-13, 公開日: 2023-01-25, 最終更新日: 2024-02-07)

• 主引用文献: Mair, S.,Erharter, K.,Renard, E.,Brillet, K.,Brunner, M.,Lusser, A.,Kreutz, C.,Ennifar, E.,Micura, R.; Towards a comprehensive understanding of RNA deamination: synthesis and properties of xanthosine-modified RNA.; Nucleic Acids Res., 50:6038-6051, 2022; PubMed: 35687141; DOI: 10.1093/nar/gkac477

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (0.86 Å)