6ZCM

Crystal structure of YTHDC1 with compound DHU_DC1_180

6ZCM の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb6zcm/pdb
• 分子名称: YTHDC1, 6-[[cyclopropyl-[(7-methoxy-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]amino]methyl]-1~{H}-pyrimidine-2,4-dione, SULFATE ION, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: ythdc1, m6a, complex, inhibitor, rna binding protein
• 由来する生物種: Homo sapiens (Human)
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 43489.59

構造登録者

Bedi, R.K.,Huang, D.,Wiedmer, L.,Caflisch, A. (登録日: 2020-06-11, 公開日: 2020-07-29, 最終更新日: 2024-01-24)

• 主引用文献: Li, Y.,Bedi, R.K.,Wiedmer, L.,Sun, X.,Huang, D.,Caflisch, A.; Atomistic and Thermodynamic Analysis of N6-Methyladenosine (m 6 A) Recognition by the Reader Domain of YTHDC1.; J Chem Theory Comput, 17:1240-1249, 2021; PubMed: 33472367; DOI: 10.1021/acs.jctc.0c01136

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.24 Å)