6JTB

Crystal structure of dipeptidyl peptidase 11 (DPP11) with citrate from Porphyromonas gingivalis (Space)

6JTB の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb6jtb/pdb
• 関連するPDBエントリー: 4Y04
• 分子名称: Asp/Glu-specific dipeptidyl-peptidase, DI(HYDROXYETHYL)ETHER, CITRIC ACID, ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: dipeptidyl aminopeptidase, s46, perio, microgravity, antimicrobial, hydrolase
• 由来する生物種: Porphyromonas gingivalis (strain ATCC 33277 / DSM 20709 / CIP 103683 / JCM 12257 / NCTC 11834 / 2561)
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 83175.27

構造登録者

Sakamoto, Y.,Suzuki, Y.,Iizuka, I.,Roppongi, S.,Kushibiki, C.,Nakamura, A.,Ogasawara, W.,Tanaka, N. (登録日: 2019-04-10, 公開日: 2019-10-02, 最終更新日: 2023-11-22)

• 主引用文献: Sakamoto, Y.,Suzuki, Y.,Nakamura, A.,Watanabe, Y.,Sekiya, M.,Roppongi, S.,Kushibiki, C.,Iizuka, I.,Tani, O.,Sakashita, H.,Inaka, K.,Tanaka, H.,Yamada, M.,Ohta, K.,Honma, N.,Shida, Y.,Ogasawara, W.,Nakanishi-Matsui, M.,Nonaka, T.,Gouda, H.,Tanaka, N.; Fragment-based discovery of the first nonpeptidyl inhibitor of an S46 family peptidase.; Sci Rep, 9:13587-13587, 2019; PubMed: 31537874; DOI: 10.1038/s41598-019-49984-3

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.5 Å)