6IYV

Crystal sturucture of L,D-transpeptidase LdtMt2 from Mycobacterium tuberculosis in complex with ertapenem adduct

6IYV の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb6iyv/pdb
• 関連するPDBエントリー: 3VYO 3VYP
• 分子名称: L,D-transpeptidase 2, (2S,3R,4S)-4-({(3S,5S)-5-[(3-carboxyphenyl)carbamoyl]pyrrolidin-3-yl}sulfanyl)-2-[(1S,2R)-1-formyl-2-hydroxypropyl]-3-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrole-5-carboxylic acid, GLYCEROL, ... (7 entities in total)
• 機能のキーワード: ld-transpeptidase, peptidoglycan synthesis enzyme, beta-lactam binding, transferase
• 由来する生物種: Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 61411.83

構造登録者

Zhao, F.,Li, D.F.,Wang, D.C. (登録日: 2018-12-17, 公開日: 2019-02-27, 最終更新日: 2023-11-22)

• 主引用文献: Zhao, F.,Hou, Y.J.,Zhang, Y.,Wang, D.C.,Li, D.F.; The 1-beta-methyl group confers a lower affinity of l,d-transpeptidase LdtMt2for ertapenem than for imipenem.; Biochem. Biophys. Res. Commun., 510:254-260, 2019; PubMed: 30686533; DOI: 10.1016/j.bbrc.2019.01.082

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.5 Å)