6EQS
Human Sirt5 in complex with stalled peptidylimidate intermediate of inhibitory compound 29
6EQS の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb6eqs/pdb |
分子名称 | NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial, ZINC ION, 3-[[(~{Z})-~{C}-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-5-[[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxymethyl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]sulfanyl-~{N}-[(5~{S})-6-[[(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-1-oxidanylidene-1-(propan-2-ylamino)propan-2-yl]amino]-6-oxidanylidene-5-(phenylmethoxycarbonylamino)hexyl]carbonimidoyl]amino]propanoic acid, ... (7 entities in total) |
機能のキーワード | hydrolase, ptm, inhibitor, signaling protein |
由来する生物種 | Homo sapiens (Human) |
細胞内の位置 | Mitochondrion matrix. Isoform 1: Cytoplasm . Isoform 2: Mitochondrion : Q9NXA8 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 4 |
化学式量合計 | 126442.51 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Rajabi, N.,Auth, M.,Troelsen, K.R.,Pannek, M.,Bhatt, D.P.,Fontenas, M.,Hirschey, M.D.,Steegborn, C.,Madsen, A.S.,Olsen, C.A. Mechanism-Based Inhibitors of the Human Sirtuin 5 Deacylase: Structure-Activity Relationship, Biostructural, and Kinetic Insight. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 56:14836-14841, 2017 Cited by PubMed: 29044784DOI: 10.1002/anie.201709050 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.32 Å) |
構造検証レポート
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