6E6I

Crystal structure of 4-methyl HOPDA bound to LigY from Sphingobium sp. strain SYK-6

6E6I の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb6e6i/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5VN5
• 分子名称: 2,2',3-trihydroxy-3'-methoxy-5,5'-dicarboxybiphenyl meta-cleavage compound hydrolase, ZINC ION, (1Z,3E)-5-carboxy-3-methyl-5-oxo-1-phenylpenta-1,3-dien-1-olate, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: c-c hydrolase, amidohydrolase superfamily, meta-cleavage, aromatic compound, hydrolase
• 由来する生物種: Sphingobium sp. SYK-6
• タンパク質・核酸の鎖数: 9
• 化学式量合計: 338589.46

構造登録者

Kuatsjah, E.,Chan, A.C.,Hurst, T.E.,Snieckus, V.,Murphy, M.E.,Eltis, L.D. (登録日: 2018-07-24, 公開日: 2019-01-30, 最終更新日: 2023-10-11)

• 主引用文献: Kuatsjah, E.,Chan, A.C.K.,Hurst, T.E.,Snieckus, V.,Murphy, M.E.P.,Eltis, L.D.; Metal- and Serine-Dependent Meta-Cleavage Product Hydrolases Utilize Similar Nucleophile-Activation Strategies; Acs Catalysis, 8:11622-11632, 2018; DOI: 10.1021/acscatal.8b02955

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å)