6CDE

Cryo-EM structure at 3.8 A resolution of vaccine-elicited antibody vFP20.01 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP, and antibodies VRC03 and PGT122

6CDE の概要

EMDBエントリー7459
分子名称vFP20.01 Heavy Chain, vFP20.01 Light chain, PGT122 Heavy chain, ... (11 entities in total)
機能のキーワードhiv-1 env, bg505 sosip, fusion peptide, vrc03, pgt122, vfp20.01, viral protein
由来する生物種Homo sapiens (human)
詳細
ポリマー鎖数24
分子量合計679408.28
構造登録者
Acharya, P.,Xu, K.,Liu, K.,Carragher, B.,Potter, C.S.,Kwong, P.D. (登録日: 2018-02-08, 公開日: 2018-05-16, 最終更新日: 2018-06-20)
主引用文献
Xu, K.,Acharya, P.,Kong, R.,Cheng, C.,Chuang, G.Y.,Liu, K.,Louder, M.K.,O'Dell, S.,Rawi, R.,Sastry, M.,Shen, C.H.,Zhang, B.,Zhou, T.,Asokan, M.,Bailer, R.T.,Chambers, M.,Chen, X.,Choi, C.W.,Dandey, V.P.,Doria-Rose, N.A.,Druz, A.,Eng, E.T.,Farney, S.K.,Foulds, K.E.,Geng, H.,Georgiev, I.S.,Gorman, J.,Hill, K.R.,Jafari, A.J.,Kwon, Y.D.,Lai, Y.T.,Lemmin, T.,McKee, K.,Ohr, T.Y.,Ou, L.,Peng, D.,Rowshan, A.P.,Sheng, Z.,Todd, J.P.,Tsybovsky, Y.,Viox, E.G.,Wang, Y.,Wei, H.,Yang, Y.,Zhou, A.F.,Chen, R.,Yang, L.,Scorpio, D.G.,McDermott, A.B.,Shapiro, L.,Carragher, B.,Potter, C.S.,Mascola, J.R.,Kwong, P.D.
Epitope-based vaccine design yields fusion peptide-directed antibodies that neutralize diverse strains of HIV-1.
Nat. Med., 24:857-867, 2018
PubMed: 29867235 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1038/s41591-018-0042-6
MImport into Mendeley
実験手法
ELECTRON MICROSCOPY (3.8 Å)
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構造検証レポート

ClashscoreRamachandran outliersSidechain outliers601.5%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all structuresPercentile relative to all EM structures
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