6AB8

Crystal structure of Methanosarcina mazei PylRS(Y306A/Y384F) complexed with ZLys

6AB8 の概要

関連するPDBエントリー6AAC 6AAD 6AAN 6AAO 6AAP 6AAQ 6AAZ 6AB0 6AB1 6AB2
分子名称Pyrrolysine--tRNA ligase, MAGNESIUM ION, ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, ... (6 entities in total)
機能のキーワードaminoacyl-trna synthetase, pyrrolysyl-trna synthetase, trna, non-natural amino acids, translation
由来する生物種Methanosarcina mazei JCM 9314 (Methanosarcina frisia)
ポリマー鎖数1
分子量合計32565.91
構造登録者
Yanagisawa, T.,Kuratani, M.,Yokoyama, S. (登録日: 2018-07-20, 公開日: 2019-04-17, 最終更新日: 2019-05-22)
主引用文献
Yanagisawa, T.,Kuratani, M.,Seki, E.,Hino, N.,Sakamoto, K.,Yokoyama, S.
Structural Basis for Genetic-Code Expansion with Bulky Lysine Derivatives by an Engineered Pyrrolysyl-tRNA Synthetase.
Cell Chem Biol, 2019
PubMed: 31031143 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1016/j.chembiol.2019.03.008
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実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.753 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers 0.21340 1.3% 4.2%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (6ab8.pdb1.gz [100.91 KB])