5YKA

Crystal structure of the Kdo hydroxylase KdoO, a non-heme Fe(II) alphaketoglutarate dependent dioxygenase in complex with cobalt(II)

5YKA の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5yka/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5Y7S 5Y9X 5Y9Y
• 分子名称: Uncharacterized protein KdoO, COBALT (II) ION, SULFATE ION, ... (8 entities in total)
• 機能のキーワード: fe(ii)/o2/alphaketoglutarate dependent dioxygenase, kdo2-lipid a dioxygenase, deoxysugar dioxygenase, lps biosynthesis, biosynthetic protein
• 由来する生物種: Methylacidiphilum infernorum (isolate V4)
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 38635.48

構造登録者

Chung, H.S.,Pemble, C.W.,Joo, S.H.,Raetz, C.R. (登録日: 2017-10-12, 公開日: 2018-09-05, 最終更新日: 2024-03-27)

• 主引用文献: Joo, S.H.,Pemble, C.W.,Yang, E.G.,Raetz, C.R.H.,Chung, H.S.; Biochemical and Structural Insights into an Fe(II)/ alpha-Ketoglutarate/O2-Dependent Dioxygenase, Kdo 3-Hydroxylase (KdoO).; J. Mol. Biol., 430:4036-4048, 2018; PubMed: 30092253; DOI: 10.1016/j.jmb.2018.07.029

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.448 Å)