5WPB
Crystal structure of fragment 3-(3-(pyridin-2-ylmethoxy)quinoxalin-2-yl)propanoic acid bound in the ubiquitin binding pocket of the HDAC6 zinc-finger domain
5WPB の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb5wpb/pdb |
分子名称 | Histone deacetylase 6, ZINC ION, 3-{3-[(pyridin-2-yl)methoxy]quinoxalin-2-yl}propanoic acid, ... (5 entities in total) |
機能のキーワード | histone deacetylase, hdac, hdac6, fragment screening, structural genomics consortium, sgc, hydrolase-hydrolase inhibitor complex, hydrolase/hydrolase inhibitor |
由来する生物種 | Homo sapiens (Human) |
タンパク質・核酸の鎖数 | 1 |
化学式量合計 | 12133.75 |
構造登録者 | Harding, R.J.,Tempel, W.,Ferreira de Freitas, R.,Franzoni, I.,Ravichandran, M.,Lautens, M.,Santhakumar, V.,Schapira, M.,Bountra, C.,Edwards, A.M.,Arrowsmith, C.H.,Structural Genomics Consortium (SGC) (登録日: 2017-08-04, 公開日: 2017-08-23, 最終更新日: 2024-03-13) |
主引用文献 | Harding, R.J.,Ferreira de Freitas, R.,Collins, P.,Franzoni, I.,Ravichandran, M.,Ouyang, H.,Juarez-Ornelas, K.A.,Lautens, M.,Schapira, M.,von Delft, F.,Santhakumar, V.,Arrowsmith, C.H. Small Molecule Antagonists of the Interaction between the Histone Deacetylase 6 Zinc-Finger Domain and Ubiquitin. J. Med. Chem., 60:9090-9096, 2017 Cited by PubMed: 29019676DOI: 10.1021/acs.jmedchem.7b00933 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.55 Å) |
構造検証レポート
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