5W4K

Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with Klebsazolicin and bound to mRNA and A-, P- and E-site tRNAs at 2.7A resolution

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5W4K の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5w4k/pdb
• 関連するBIRD辞書のPRD_ID: PRD_002277
• 分子名称: 23S Ribosomal RNA, 50S ribosomal protein L14, 50S ribosomal protein L15, ... (63 entities in total)
• 機能のキーワード: klebsazolicin, antibiotic, ripps, ribosome inhibitor, 70s ribosome, inhibition of translation, peptidyl transferase center, nascent peptide exit tunnel, ribosome-antibiotic complex, ribosome/antibiotic
• 由来する生物種: Escherichia coli; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 114
• 化学式量合計: 4576710.22

構造登録者

Metelev, M.,Osterman, I.A.,Ghilarov, D.,Khabibullina, N.F.,Yakimov, A.,Shabalin, K.,Utkina, I.,Travin, D.Y.,Komarova, E.S.,Serebryakova, M.,Artamonova, T.,Khodorkovskii, M.,Konevega, A.L.,Sergiev, P.V.,Severinov, K.,Polikanov, Y.S. (登録日: 2017-06-12, 公開日: 2017-08-30, 最終更新日: 2019-12-04)

• 主引用文献: Metelev, M.,Osterman, I.A.,Ghilarov, D.,Khabibullina, N.F.,Yakimov, A.,Shabalin, K.,Utkina, I.,Travin, D.Y.,Komarova, E.S.,Serebryakova, M.,Artamonova, T.,Khodorkovskii, M.,Konevega, A.L.,Sergiev, P.V.,Severinov, K.,Polikanov, Y.S.; Klebsazolicin inhibits 70S ribosome by obstructing the peptide exit tunnel.; Nat. Chem. Biol., 13:1129-1136, 2017; PubMed: 28846667; DOI: 10.1038/nchembio.2462

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å)