5VMW
Kaiso (ZBTB33) zinc finger DNA binding domain in complex with a double CpG-methylated DNA resembling the specific Kaiso binding sequence (KBS)
5VMW の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb5vmw/pdb |
関連するPDBエントリー | 5VMU 5VMV 5VMX 5VMY 5VMZ |
分子名称 | Transcriptional regulator Kaiso, DNA (5'-D(*TP*GP*CP*TP*TP*CP*CP*(5CM)P*GP*(5CM)P*GP*AP*AP*TP*AP*AP*CP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*GP*TP*TP*AP*TP*TP*(5CM)P*GP*(5CM)P*GP*GP*GP*AP*AP*GP*CP*A)-3'), ... (6 entities in total) |
機能のキーワード | dna methylation, zinc finger, transcriptional regulator, transcription-dna complex, transcription/dna |
由来する生物種 | Homo sapiens (Human) 詳細 |
細胞内の位置 | Nucleus : Q86T24 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 3 |
化学式量合計 | 27538.72 |
構造登録者 | Nikolova, E.N.,Stanfield, R.L.,Martinez-Yamout, M.A.,Dyson, H.J.,Wright, P.E. (登録日: 2017-04-28, 公開日: 2018-04-04, 最終更新日: 2023-10-04) |
主引用文献 | Nikolova, E.N.,Stanfield, R.L.,Dyson, H.J.,Wright, P.E. CH···O Hydrogen Bonds Mediate Highly Specific Recognition of Methylated CpG Sites by the Zinc Finger Protein Kaiso. Biochemistry, 57:2109-2120, 2018 Cited by PubMed: 29546986DOI: 10.1021/acs.biochem.8b00065 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.397 Å) |
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