5LIG

G-Quadruplex formed at the 5'-end of NHEIII_1 Element in human c-MYC promoter bound to triangulenium based fluorescence probe DAOTA-M2

5LIG の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5lig/pdb
• NMR情報: BMRB: 34025
• 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*TP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*T)-3'), 8,12-bis(2-morpholinoethyl)-8H-benzo[ij]xantheno[1,9,8-cdef][2,7]naphthyridin-12-iumhexafluorophosphate (2 entities in total)
• 機能のキーワード: dna, g-quadruplex, c-myc promoter, ligand, daota-m2
• 由来する生物種: Homo sapiens (human)
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 7092.17

構造登録者

Kotar, A.,Wang, B.,Shivalingam, A.,Gonzalez-Garcia, J.,Vilar, R.,Plavec, J. (登録日: 2016-07-14, 公開日: 2016-09-14, 最終更新日: 2024-05-15)

• 主引用文献: Kotar, A.,Wang, B.,Shivalingam, A.,Gonzalez-Garcia, J.,Vilar, R.,Plavec, J.; NMR Structure of a Triangulenium-Based Long-Lived Fluorescence Probe Bound to a G-Quadruplex.; Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 55:12508-12511, 2016; PubMed: 27577037; DOI: 10.1002/anie.201606877

実験手法

SOLUTION NMR