5KH9
Crystal structure of a low occupancy fragment candidate (5-[(4-Isopropylphenyl)amino]-6-methyl-1,2,4-triazin-3(2H)-one) bound in the ubiquitin binding pocket of the HDAC6 zinc-finger domain
5KH9 の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb5kh9/pdb |
関連するPDBエントリー | 5B8D 5KH3 5KH7 |
分子名称 | Histone deacetylase 6, ZINC ION, FORMIC ACID, ... (7 entities in total) |
機能のキーワード | histone deacetylase, hdac, hdac6, fragment screening, structural genomics consortium, sgc, diamond i04-1 xchem, pandda, hydrolase |
由来する生物種 | Homo sapiens (Human) |
タンパク質・核酸の鎖数 | 1 |
化学式量合計 | 12442.14 |
構造登録者 | Harding, R.J.,Tempel, W.,Ravichandran, M.,Collins, P.,Pearce, N.,Brandao-Neto, J.,Douangamath, A.,Schapira, M.,Bountra, C.,Edwards, A.M.,von Delft, F.,Santhakumar, V.,Arrowsmith, C.M.,Structural Genomics Consortium (SGC) (登録日: 2016-06-14, 公開日: 2016-07-27, 最終更新日: 2023-09-27) |
主引用文献 | Harding, R.J.,Ferreira de Freitas, R.,Collins, P.,Franzoni, I.,Ravichandran, M.,Ouyang, H.,Juarez-Ornelas, K.A.,Lautens, M.,Schapira, M.,von Delft, F.,Santhakumar, V.,Arrowsmith, C.H. Small Molecule Antagonists of the Interaction between the Histone Deacetylase 6 Zinc-Finger Domain and Ubiquitin. J. Med. Chem., 60:9090-9096, 2017 Cited by PubMed: 29019676DOI: 10.1021/acs.jmedchem.7b00933 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.07 Å) |
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