5IPK

Structure of the R432A variant of Adeno-associated virus type 2 VLP

これは巨大構造です。

5IPK の概要

関連するPDBエントリー5IPI
EMDBエントリー8100 8099
分子名称Capsid protein VP1 (1 entity in total)
機能のキーワードadeno-associated virus, r432a, gene therapy, icosahedral, dependoparvovirus, virus like particle
由来する生物種Adeno-associated virus - 2 (AAV-2)
細胞内の位置Virion  P03135
ポリマー鎖数60
分子量合計4916714.04
構造登録者
Drouin, L.M.,Lins, B.,Janssen, M.E.,Bennet, A.,Chipman, P.,McKenna, R.,Chen, W.,Muzyczka, N.,Cardone, G.,Baker, T.S.,Agbandje-McKenna, M. (登録日: 2016-03-09, 公開日: 2016-07-20, 最終更新日: 2017-09-13)
主引用文献
Drouin, L.M.,Lins, B.,Janssen, M.,Bennett, A.,Chipman, P.,McKenna, R.,Chen, W.,Muzyczka, N.,Cardone, G.,Baker, T.S.,Agbandje-McKenna, M.
Cryo-electron Microscopy Reconstruction and Stability Studies of the Wild Type and the R432A Variant of Adeno-associated Virus Type 2 Reveal that Capsid Structural Stability Is a Major Factor in Genome Packaging.
J.Virol., 90:8542-8551, 2016
PubMed: 27440903 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1128/JVI.00575-16
MImport into Mendeley
実験手法
ELECTRON MICROSCOPY (3.7 Å)
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構造検証レポート

ClashscoreRamachandran outliersSidechain outliers202.6%0.5%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all structuresPercentile relative to all EM structures
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