5GGO

Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GalNac-beta1,3-GlcNAc-beta-pNP

5GGO の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5ggo/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5GGF 5GGG 5GGI 5GGJ 5GGK 5GGL 5GGN 5GGP
• 分子名称: Protein O-linked-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase 1, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-4-nitrophenyl 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranoside, 1,2-ETHANEDIOL, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: glycosyltransferease, o-mannosylation, alpha-dystroglycan, sugar binding protein
• 由来する生物種: Homo sapiens (Human)
• 細胞内の位置: Golgi apparatus membrane ; Single-pass type II membrane protein : Q8WZA1
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 36399.10

構造登録者

Kuwabara, N.,Senda, T.,Kato, R. (登録日: 2016-06-16, 公開日: 2016-08-10, 最終更新日: 2023-11-08)

• 主引用文献: Kuwabara, N.,Manya, H.,Yamada, T.,Tateno, H.,Kanagawa, M.,Kobayashi, K.,Akasaka-Manya, K.,Hirose, Y.,Mizuno, M.,Ikeguchi, M.,Toda, T.,Hirabayashi, J.,Senda, T.,Endo, T.,Kato, R.; Carbohydrate-binding domain of the POMGnT1 stem region modulates O-mannosylation sites of alpha-dystroglycan; Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 113:9280-9285, 2016; PubMed: 27493216; DOI: 10.1073/pnas.1525545113

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.502 Å)