5DI4

Two divalent metal ions and conformational changes play roles in the hammerhead ribozyme cleavage reaction-WT ribozyme in Mn2+ at low pH

5DI4 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5di4/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5DH6 5DH7 5DH8 5DI2
• 分子名称: RNA (48-MER), 5'-R(*GP*GP*GP*CP*GP*U)-D(P*C)-R(P*UP*GP*GP*GP*CP*AP*GP*UP*AP*CP*CP*CP*A)-3', MANGANESE (II) ION (3 entities in total)
• 機能のキーワード: ribozyme, hammerhead, rna
• 由来する生物種: synthetic construct; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 22542.50

構造登録者

Mir, A.,Chen, J.,Neau, D.,Golden, B.L. (登録日: 2015-08-31, 公開日: 2015-10-07, 最終更新日: 2024-03-06)

• 主引用文献: Mir, A.,Chen, J.,Robinson, K.,Lendy, E.,Goodman, J.,Neau, D.,Golden, B.L.; Two Divalent Metal Ions and Conformational Changes Play Roles in the Hammerhead Ribozyme Cleavage Reaction.; Biochemistry, 54:6369-6381, 2015; PubMed: 26398724; DOI: 10.1021/acs.biochem.5b00824

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.948 Å)