5A7Q

Crystal structure of human JMJD2A in complex with compound 30

5A7Q の概要

関連するPDBエントリー5A7N 5A7O 5A7P 5A7S
分子名称LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE 4A, MANGANESE (II) ION, 2-(5-azanyl-2-oxidanyl-phenyl)pyridine-4-carboxylic acid, ... (7 entities in total)
機能のキーワードoxidoreductase, jmjd2a, kdm4a
由来する生物種HOMO SAPIENS (HUMAN)
細胞内の位置Nucleus  O75164
ポリマー鎖数2
分子量合計89631.98
構造登録者
主引用文献
Korczynska, M.,Le, D.D.,Younger, N.,Gregori-Puigjane, E.,Tumber, A.,Krojer, T.,Velupillai, S.,Gileadi, C.,Nowak, R.P.,Iwasa, E.,Pollock, S.B.,Ortiz Torres, I.,Oppermann, U.,Shoichet, B.K.,Fujimori, D.G.
Docking and Linking of Fragments to Discover Jumonji Histone Demethylase Inhibitors.
J.Med.Chem., 59:1580-, 2016
PubMed: 26699912 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1021/ACS.JMEDCHEM.5B01527
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.232300.9%3.2%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (5a7q.pdb1.gz [129.07 KB])
生物学的単位の座標ファイル (5a7q.pdb2.gz [129.36 KB])