4NII

Crystal structure of AlkB D135I mutant protein with cofactors bound to dsDNA containing m6A/A

4NII の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb4nii/pdb
• 関連するPDBエントリー: 4NID 4NIG 4NIH
• 分子名称: Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB, 5'-D(*TP*AP*GP*GP*TP*AP*AP*(6MA)P*AP*CP*CP*GP*T)-3', 5'-D(*AP*AP*CP*GP*GP*TP*AP*TP*TP*AP*CP*CP*T)-3', ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: dna/rna direct repair, jelly-roll fold, dna/rna demethylation repair, fe(ii), 2-kg, oxidoreductase-dna complex, oxidoreductase/dna
• 由来する生物種: Escherichia coli
• タンパク質・核酸の鎖数: 3
• 化学式量合計: 31053.59

構造登録者

Yi, C.Q.,Zhu, C.X. (登録日: 2013-11-06, 公開日: 2014-04-16, 最終更新日: 2023-09-20)

• 主引用文献: Zhu, C.,Yi, C.; Switching Demethylation Activities between AlkB Family RNA/DNA Demethylases through Exchange of Active-Site Residues.; Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 53:3659-3662, 2014; PubMed: 24596302; DOI: 10.1002/anie.201310050

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.622 Å)