4D11

GalNAc-T2 crystal soaked with UDP-5SGalNAc, mEA2 peptide and manganese (Lower resolution dataset)

4D11 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb4d11/pdb
• 関連するPDBエントリー: 4D0T 4D0Z
• 分子名称: POLYPEPTIDE GALNAC-TRANSFERASE T2, PEPTIDE, MANGANESE (II) ION, ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: transferase-peptide complex, retaining galnac-t2, substrate-guided sni-type reaction, qm/mm metadynamics, bi-bi kinetic mechanism, substrate specificity, acetamido group, transferase/peptide
• 由来する生物種: HOMO SAPIENS (HUMAN); 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 11
• 化学式量合計: 395424.98

構造登録者

Lira-Navarrete, E.,Iglesias-Fernandez, J.,Zandberg, W.F.,Companon, I.,Kong, Y.,Corzana, F.,Pinto, B.M.,Clausen, H.,Peregrina, J.M.,Vocadlo, D.,Rovira, C.,Hurtado-Guerrero, R. (登録日: 2014-05-01, 公開日: 2014-05-28, 最終更新日: 2023-12-20)

• 主引用文献: Lira-Navarrete, E.,Iglesias-Fernandez, J.,Zandberg, W.F.,Companon, I.,Kong, Y.,Corzana, F.,Pinto, B.M.,Clausen, H.,Peregrina, J.M.,Vocadlo, D.,Rovira, C.,Hurtado-Guerrero, R.; Substrate-Guided Front-Face Reaction Revealed by Combined Structural Snapshots and Metadynamics for the Polypeptide N- Acetylgalactosaminyltransferase 2.; Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 53:8206-, 2014; PubMed: 24954443; DOI: 10.1002/ANIE.201402781

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.85 Å)