3ZYB

CRYSTAL STRUCTURE OF PA-IL LECTIN COMPLEXED WITH GALAG0 AT 2.3 A RESOLUTION

3ZYB の概要

関連するPDBエントリー2VXJ 1OKO 1UOJ 2WYF 1L7L 3ZYF 3ZYH
分子名称PA-I galactophilic lectin, GALA-LYS-PRO-LEUNH2, CALCIUM ION, ... (6 entities in total)
機能のキーワードsugar binding protein, adhesin, glycosphingolipid-antigen, galactose-specific, galactosides
由来する生物種Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1)
詳細
細胞内の位置Cytoplasm Q05097
ポリマー鎖数11
分子量合計107143.93
構造登録者
主引用文献
Kadam, R.U.,Bergmann, M.,Hurley, M.,Garg, D.,Cacciarini, M.,Swiderska, M.A.,Nativi, C.,Sattler, M.,Smyth, A.R.,Williams, P.,Camara, M.,Stocker, A.,Darbre, T.,Reymond, J.-L.
A Glycopeptide Dendrimer Inhibitor of the Galactose-Specific Lectin Leca and of Pseudomonas Aeruginosa Biofilms.
Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 50:10631-, 2011
PubMed: 21919164 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1002/ANIE.201104342
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2.29 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.234500.1%0.4%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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回転なし
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x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

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回転なし
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x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (3zyb.pdb5.gz [25.2 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3zyb.pdb6.gz [25.33 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3zyb.pdb8.gz [25.22 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3zyb.pdb7.gz [25.02 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3zyb.pdb1.gz [25.95 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3zyb.pdb2.gz [25.83 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3zyb.pdb3.gz [25.63 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3zyb.pdb4.gz [25.72 KB])