3VYB

Crystal structure of methyl CpG binding domain of MBD4 in complex with the 5mCG/hmCG sequence

3VYB の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb3vyb/pdb
• 関連するPDBエントリー: 3VXV 3VXX 3VYQ
• 分子名称: Methyl-CpG-binding domain protein 4, DNA (5'-D(*GP*TP*CP*AP*CP*TP*AP*CP*(5CM)P*GP*GP*AP*CP*A)-3'), DNA (5'-D(*GP*TP*CP*(5HC)P*GP*GP*TP*AP*GP*TP*GP*AP*CP*T)-3'), ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: methyl cpg binding domain, protein-dna complex, versatile base recognition, hydrolase-dna complex, hydrolase/dna
• 由来する生物種: Mus musculus (mouse)
• 細胞内の位置: Nucleus: Q9Z2D7
• タンパク質・核酸の鎖数: 3
• 化学式量合計: 16555.84

構造登録者

Otani, J.,Arita, K.,Kato, T.,Kinoshita, M.,Ariyoshi, M.,Shirakawa, M. (登録日: 2012-09-22, 公開日: 2013-01-16, 最終更新日: 2023-11-08)

• 主引用文献: Otani, J.,Arita, K.,Kato, T.,Kinoshita, M.,Kimura, H.,Suetake, I.,Tajima, S.,Ariyoshi, M.,Shirakawa, M.; Structural basis of the versatile DNA recognition ability of the methyl-CpG binding domain of methyl-CpG binding domain protein 4; J.Biol.Chem., 288:6351-6362, 2013; PubMed: 23316048; DOI: 10.1074/jbc.M112.431098

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å)