3GBI

The Rational Design and Structural Analysis of a Self-Assembled Three-Dimensional DNA Crystal

3GBI の概要

分子名称DNA (5'-D(*GP*AP*GP*CP*AP*GP*CP*CP*TP*GP*TP*AP*CP*GP*GP*AP*CP*AP*TP*CP*A)-3'), DNA (5'-D(P*CP*CP*GP*TP*AP*CP*A)-3'), DNA (5'-D(P*GP*GP*CP*TP*GP*C)-3'), ... (4 entities in total)
機能のキーワードnanotechnology, dna crystals, dna crossover, designed crystal lattice, dna
ポリマー鎖数4
分子量合計12797.42
構造登録者
Birktoft, J.J.,Zheng, J.,Seeman, N.C. (登録日: 2009-02-19, 公開日: 2009-09-01, 最終更新日: 2017-11-01)
主引用文献
Zheng, J.,Birktoft, J.J.,Chen, Y.,Wang, T.,Sha, R.,Constantinou, P.E.,Ginell, S.L.,Mao, C.,Seeman, N.C.
From molecular to macroscopic via the rational design of a self-assembled 3D DNA crystal.
Nature, 461:74-77, 2009
PubMed: 19727196 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1038/nature08274
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実験手法
X-RAY DIFFRACTION (4.018 Å)
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構造検証レポート

ClashscoreRSRZ outliers810MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 3gbi
回転なし
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他の静止画像(生物学的単位)

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x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (3gbi.pdb1.gz [43.91 KB])
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