3DCK

X-ray structure of D25N chemical analogue of HIV-1 protease complexed with ketomethylene isostere inhibitor

3DCK の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb3dck/pdb
• 関連するPDBエントリー: 3DCR
• 関連するBIRD辞書のPRD_ID: PRD_001174
• 分子名称: Chemical analogue HIV-1 protease, (2S)-2-{[(2R,5S)-5-{[(2S,3S)-2-{[(2S,3R)-2-(acetylamino)-3-hydroxybutanoyl]amino}-3-methylpentanoyl]amino}-2-butyl-4-oxononanoyl]amino}-N~1~-[(2S)-1-amino-5-carbamimidamido-1-oxopentan-2-yl]pentanediamide (3 entities in total)
• 機能のキーワード: hiv-1 protease, homodimer, beta-turns, beta-strand, hydrolase, hydrolase-hydrolase inhibitor complex, hydrolase/hydrolase inhibitor
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 22302.25

構造登録者

Torbeev, V.Y.,Mandal, K.,Terechko, V.A.,Kent, S.B.H. (登録日: 2008-06-03, 公開日: 2008-08-19, 最終更新日: 2024-03-20)

• 主引用文献: Torbeev, V.Y.,Mandal, K.,Terechko, V.A.,Kent, S.B.H.; Crystal structure of chemically synthesized HIV-1 protease and a ketomethylene isostere inhibitor based on the p2/NC cleavage site; Bioorg.Med.Chem.Lett., 18:4554-4557, 2008; PubMed: 18657969; DOI: 10.1016/j.bmcl.2008.07.039

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å)