2VGK

Crystal structure of Actinomadura R39 DD-peptidase complexed with a peptidoglycan-mimetic cephalosporin

2VGK の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb2vgk/pdb
• 関連するPDBエントリー: 1W79 1W8Q 1W8Y 2VGJ
• 分子名称: D-ALANYL-D-ALANINE CARBOXYPEPTIDASE, (2R)-2-AMINO-7-{[(1R)-1-CARBOXYETHYL]AMINO}-7-OXOHEPTANOIC ACID, SULFATE ION, ... (5 entities in total)
• 機能のキーワード: cell wall biogenesis/degradation, antibiotic resistance, peptidoglycan synthesis, protease, secreted, hydrolase, cell shape, carboxypeptidase, penicillin-binding, actinomadura, peptidoglycan, transpeptidase
• 由来する生物種: ACTINOMADURA SP.
• 細胞内の位置: Secreted: P39045
• タンパク質・核酸の鎖数: 4
• 化学式量合計: 203092.51

構造登録者

Sauvage, E.,kerff, F.,Herman, R.,Charlier, P. (登録日: 2007-11-14, 公開日: 2008-11-25, 最終更新日: 2023-12-13)

• 主引用文献: Sauvage, E.,Powell, A.J.,Heilemann, J.,Josephin, H.R.,Charlier, P.,Davies, C.,Pratt, R.F.; Crystal Structures of Complexes of Bacterial Dd-Peptidases with Peptidoglycan-Mimetic Ligands: The Substrate Specificity Puzzle.; J.Mol.Biol., 381:383-, 2008; PubMed: 18602645; DOI: 10.1016/J.JMB.2008.06.012

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å)