2IPK
Crystal Structure of the MHC Class II Molecule HLA-DR1 in Complex with the Fluorogenic Peptide, AcPKXVKQNTLKLAT (X=3-[5-(dimethylamino)-1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl]-L-alanine) and the Superantigen, SEC3 Variant 3B2
2IPK の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb2ipk/pdb |
関連するPDBエントリー | 1DLH 1JWU |
分子名称 | HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-1 beta chain, HA related Fluorogenic Peptide, AcPKXVKQNTLKLAT (X=3-[5-(dimethylamino)-1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl]-L-alanine), ... (5 entities in total) |
機能のキーワード | hla, dr1, mhc, major histocompatibility complex, fluorogenic probe, sec3, 4-(n, n-dimethylamino)phthalimidoalanyl, dapa, immune system |
由来する生物種 | Homo sapiens (human) 詳細 |
細胞内の位置 | Cell membrane; Single-pass type I membrane protein: P01903 P04229 Secreted: P0A0L3 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 4 |
化学式量合計 | 72848.96 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Venkatraman, P.,Nguyen, T.T.,Sainlos, M.,Bilsel, O.,Chitta, S.,Imperiali, B.,Stern, L.J. Fluorogenic probes for monitoring peptide binding to class II MHC proteins in living cells. Nat.Chem.Biol., 3:222-228, 2007 Cited by PubMed: 17351628DOI: 10.1038/nchembio868 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) |
構造検証レポート
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