2GVE

Time-of-Flight Neutron Diffraction Structure of D-Xylose Isomerase

2GVE の概要

関連するPDBエントリー1XIB 2GLK 2GUB
分子名称Xylose isomerase, COBALT (II) ION (3 entities in total)
機能のキーワードtim barrel-beta-alpha-barrels, two metal binding sites, protonation states of residues, isomerase
由来する生物種Streptomyces rubiginosus
細胞内の位置Cytoplasm P24300
ポリマー鎖数1
分子量合計43401.16
構造登録者
Katz, A.K.,Li, X.,Carrell, H.L.,Hanson, B.L.,Langan, P.,Coates, L.,Schoenborn, B.P.,Glusker, J.P.,Bunick, G.J. (登録日: 2006-05-02, 公開日: 2006-05-16, 最終更新日: 2017-10-18)
主引用文献
Katz, A.K.,Li, X.,Carrell, H.L.,Hanson, B.L.,Langan, P.,Coates, L.,Schoenborn, B.P.,Glusker, J.P.,Bunick, G.J.
Locating active-site hydrogen atoms in D-xylose isomerase: Time-of-flight neutron diffraction.
Proc.Natl.Acad.Sci.Usa, 103:8342-8347, 2006
PubMed: 16707576 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1073/pnas.0602598103
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実験手法
NEUTRON DIFFRACTION (2.2 Å)
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構造検証レポート

ClashscoreRamachandran outliersSidechain outliers80.8%3.6%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (2gve.pdb1.gz [489.33 KB])