2BMO

The Crystal Structure of Nitrobenzene Dioxygenase

2BMO の概要

関連するPDBエントリー2BMQ 2BMR
分子名称OXYGENASE-ALPHA NBDO, OXYGENASE-BETA NBDO, FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER, ... (8 entities in total)
機能のキーワードnitrobenzene dioxygenase, nitroarene, rieske non-heme dioxygenase, substrate specificity iron-sulfur, metal-binding, nad, oxidoreductase
由来する生物種COMAMONAS SP.
ポリマー鎖数2
分子量合計74135.05
構造登録者
Friemann, R.,Ivkovic-Jensen, M.M.,Lessner, D.J.,Yu, C.,Gibson, D.T.,Parales, R.E.,Eklund, H.,Ramaswamy, S. (登録日: 2005-03-15, 公開日: 2005-05-04, 最終更新日: 2018-02-28)
主引用文献
Friemann, R.,Ivkovic-Jensen, M.M.,Lessner, D.J.,Yu, C.L.,Gibson, D.T.,Parales, R.E.,Eklund, H.,Ramaswamy, S.
Structural insight into the dioxygenation of nitroarene compounds: the crystal structure of nitrobenzene dioxygenase.
J. Mol. Biol., 348:1139-1151, 2005
PubMed: 15854650 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1016/j.jmb.2005.03.052
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実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.2 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.17270.2%2.3%5.5%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (2bmo.pdb1.gz [729.52 KB])