2A5R

Complex of tetra-(4-n-methylpyridyl) porphin with monomeric parallel-stranded DNA tetraplex, snap-back 3+1 3' G-tetrad, single-residue chain reversal loops, GAG triad in the context of GAAG diagonal loop, C-MYC promoter, NMR, 6 struct.

2A5R の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb2a5r/pdb
• 関連するPDBエントリー: 1D6D 1EEG 1JJP 1Y8D 2A5P
• 分子名称: 5'-D(*TP*GP*AP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*IP*GP*AP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*G)-3', (1Z,4Z,9Z,15Z)-5,10,15,20-tetrakis(1-methylpyridin-1-ium-4-yl)-21,23-dihydroporphyrin (2 entities in total)
• 機能のキーワード: monomeric parallel-stranded quadruplex; c-myc promoter 3+1 g-tetrad; single nucleotide chain reversal loop; gag triad; gaag loop, dna
• 由来する生物種: Homo sapiens (human)
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 8380.76

構造登録者

Phan, A.T.,Kuryavyi, V.V.,Gaw, H.Y.,Patel, D.J. (登録日: 2005-06-30, 公開日: 2005-07-26, 最終更新日: 2011-07-13)

• 主引用文献: Phan, A.T.,Kuryavyi, V.,Gaw, H.Y.,Patel, D.J.; Small-molecule interaction with a five-guanine-tract G-quadruplex structure from the human MYC promoter.; Nat.Chem.Biol., 1:167-173, 2005; PubMed: 16408022; DOI: 10.1038/nchembio723

実験手法

SOLUTION NMR