1PWD

Covalent acyl enzyme complex of the Streptomyces R61 DD-peptidase with cephalosporin C

1PWD の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb1pwd/pdb
• 関連するPDBエントリー: 1IKG 1IKI 1MPL
• 分子名称: D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase precursor, (2R)-5-(acetyloxymethyl)-2-[(1R)-1-[[(5R)-5-azanyl-6-oxidanyl-6-oxidanylidene-hexanoyl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]-5,6-dihydro-2H-1,3-thiazine-4-carboxylic acid (3 entities in total)
• 機能のキーワード: beta-lactam, antibiotics, penicillin binding protein, enzyme, peptidoglycan, hydrolase, hydrolase-antibiotic complex, hydrolase/antibiotic
• 由来する生物種: Streptomyces sp.
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 37840.01

構造登録者

Silvaggi, N.R.,Josephine, H.R.,Pratt, R.F.,Kelly, J.A. (登録日: 2003-07-01, 公開日: 2004-07-13, 最終更新日: 2023-08-16)

• 主引用文献: Silvaggi, N.R.,Josephine, H.R.,Kuzin, A.P.,Nagarajan, R.,Pratt, R.F.,Kelly, J.A.; Crystal structures of complexes between the R61 DD-peptidase and peptidoglycan-mimetic beta-lactams: a non-covalent complex with a "perfect penicillin"; J.Mol.Biol., 345:521-533, 2005; PubMed: 15581896; DOI: 10.1016/j.jmb.2004.10.076

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.2 Å)