4RDL

Crystal structure of Norovirus Boxer P domain in complex with Lewis y tetrasaccharide

エンティティ

Entity ID	鎖名	説明	種類	鎖長	化学式量	分子数	データベース名(アクセス番号)	由来する生物種	エンティティの一般名
1	A, B	Capsid	polymer	308	33758.9	2	UniProt (Q8BCA3) Pfam (PF08435) In PDB	Human calicivirus NLV/Boxer/2001/US
2	C, D	alpha-L-fucopyranose-(1-2)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-3)]2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose	branched		675.6	2	In PDB BIRD (PRD_900124) GlyTouCan (G82236PZ)		Lewis Y antigen, alpha anomer
3		water	water		18.0	825	Chemie (HOH)

配列変更

A, B: 227 - 526 (UniProt: Q8BCA3)

PDB	外部データベース	詳細
Gly 219	-	expression tag
Pro 220	-	expression tag
Leu 221	-	expression tag
Gly 222	-	expression tag
Ser 223	-	expression tag
Pro 224	-	expression tag
Glu 225	-	expression tag
Phe 226	-	expression tag

非対称単位の内容

タンパク質・ 核酸鎖	鎖の数	2
	化学式量合計	67517.8
糖鎖	分子数	2
	化学式量合計	1351.3
全て*	化学式量合計	68869.0

*水分子は含んでいません