6FMS

IMISX-EP of Se-LspA

GO（遺伝子オントロジー）由来の情報

鎖名	GO（遺伝子オントロジー）id	名前空間	内容
A	0004190	molecular_function	aspartic-type endopeptidase activity
A	0005886	cellular_component	plasma membrane
A	0006465	biological_process	signal peptide processing
A	0006508	biological_process	proteolysis
A	0016020	cellular_component	membrane
B	0004190	molecular_function	aspartic-type endopeptidase activity
B	0005886	cellular_component	plasma membrane
B	0006465	biological_process	signal peptide processing
B	0006508	biological_process	proteolysis
B	0016020	cellular_component	membrane
C	0004190	molecular_function	aspartic-type endopeptidase activity
C	0005886	cellular_component	plasma membrane
C	0006465	biological_process	signal peptide processing
C	0006508	biological_process	proteolysis
C	0016020	cellular_component	membrane
D	0004190	molecular_function	aspartic-type endopeptidase activity
D	0005886	cellular_component	plasma membrane
D	0006465	biological_process	signal peptide processing
D	0006508	biological_process	proteolysis
D	0016020	cellular_component	membrane

PDBデータベースに由来する情報

site_id	AC1
残基数	3
詳細	binding site for residue OLC A 201

鎖名	残基
A	PHE29
A	ILE40
A	OLC202

---

site_id	AC2
残基数	3
詳細	binding site for residue OLC A 202

鎖名	残基
A	VAL42
A	TRP49
A	OLC201

---

site_id	AC3
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC A 203

鎖名	残基
D	ALA28
D	ALA32
E	OLC301
A	PRO11
A	TRP12
A	ILE15

---

site_id	AC4
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC A 204

鎖名	残基
A	PHE7
A	LEU10
A	PRO11
A	TRP14
D	GLN31
D	TYR114

---

site_id	AC5
残基数	2
詳細	binding site for residue OLC A 205

鎖名	残基
A	ARG70
A	MSE117

---

site_id	AC6
残基数	7
詳細	binding site for residue OLC B 202

鎖名	残基
B	GLY8
B	ARG9
B	PRO11
B	TRP12
B	ILE15
B	LYS93
B	LEU104

---

site_id	AC7
残基数	3
詳細	binding site for residue OLC B 203

鎖名	残基
B	LEU10
B	TRP14
C	TYR114

---

site_id	AC8
残基数	5
詳細	binding site for residue OLC B 204

鎖名	残基
A	ALA63
A	ASP64
B	TRP130
B	ARG133
B	TRP134

---

site_id	AC9
残基数	1
詳細	binding site for residue OLC B 205

鎖名	残基
B	GLU33

---

site_id	AD1
残基数	1
詳細	binding site for residue OLC B 206

鎖名	残基
B	TRP49

---

site_id	AD2
残基数	5
詳細	binding site for residue OLC C 201

鎖名	残基
C	PHE139
C	ASP143
C	THR147
G	IIL202
G	ALO204

---

site_id	AD3
残基数	3
詳細	binding site for residue OLC C 202

鎖名	残基
C	VAL41
C	TRP49
C	OLC205

---

site_id	AD4
残基数	4
詳細	binding site for residue OLC C 203

鎖名	残基
C	LEU110
C	MSE117
C	VAL118
C	OLC204

---

site_id	AD5
残基数	3
詳細	binding site for residue OLC C 204

鎖名	残基
C	ARG70
C	MSE117
C	OLC203

---

site_id	AD6
残基数	4
詳細	binding site for residue OLC C 205

鎖名	残基
C	PHE29
C	GLU33
C	TRP49
C	OLC202

---

site_id	AD7
残基数	3
詳細	binding site for residue OLC D 201

鎖名	残基
D	PHE29
D	ILE40
D	OLC202

---

site_id	AD8
残基数	2
詳細	binding site for residue OLC D 202

鎖名	残基
D	TRP49
D	OLC201

---

site_id	AD9
残基数	7
詳細	binding site for residue OLC E 301

鎖名	残基
A	PHE139
A	ASP143
A	VAL148
A	OLC203
E	IIL202
E	SER203
E	ALO204

---

site_id	AE1
残基数	8
詳細	binding site for residue OLC F 301

鎖名	残基
B	THR55
B	PRO137
B	PHE139
B	ASP143
B	THR147
F	IIL202
F	SER203
F	ALO204

---

site_id	AE2
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC H 301

鎖名	残基
D	PHE139
D	ASP143
D	THR147
H	IIL202
H	SER203
H	ALO204

---

site_id	AE3
残基数	9
詳細	binding site for Ligand residues ALO E 204 through SER E 203 bound to SER E 203

鎖名	残基
A	ASN54
A	GLY56
A	PHE59
A	PHE73
A	ASN112
A	ARG116
A	ASP124
A	ASP143
E	OLC301

---

site_id	AE4
残基数	12
詳細	binding site for Ligand residues ALO F 204 through SER F 203 bound to SER F 203

鎖名	残基
B	ASN140
B	ASP143
B	ILE146
F	OLC301
B	LEU62
B	PHE73
B	ALA77
B	VAL80
B	ASN112
B	ARG116
B	VAL122
B	ASP124

---

site_id	AE5
残基数	12
詳細	binding site for Ligand residues ALO G 204 through SER G 203 bound to SER G 203

鎖名	残基
C	ASN54
C	PHE59
C	PHE73
C	ALA77
C	ASN112
C	ARG116
C	VAL122
C	ASP124
C	ASP143
C	ILE146
C	OLC201
H	5BV205

---

site_id	AE6
残基数	13
詳細	binding site for Ligand residues ALO H 204 through SER H 203 bound to SER H 203

鎖名	残基
D	ASN54
D	ALA57
D	PHE59
D	PHE73
D	VAL80
D	ALA109
D	ASN112
D	ARG116
D	ASP124
D	ASP143
D	ILE146
G	5BV205
H	OLC301

---

UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報

site_id	PS00855
残基数	13
詳細	SPASE_II Signal peptidases II signature. VlGGALGNLYDRM

鎖名	残基	詳細
A	VAL105-MSE117

---

SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報

site_id	SWS_FT_FI1
残基数	80
詳細	TRANSMEM: Helical => ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_00161, ECO:0000269|PubMed:26912896, ECO:0000269|PubMed:30272004, ECO:0007744|PDB:5DIR, ECO:0007744|PDB:6FMS

鎖名	残基	詳細
A	LEU10-PHE30
B	LEU10-PHE30
C	LEU10-PHE30
D	LEU10-PHE30

---

site_id	SWS_FT_FI2
残基数	228
詳細	TOPO_DOM: Periplasmic => ECO:0000269|PubMed:26912896, ECO:0000269|PubMed:30272004, ECO:0007744|PDB:5DIR, ECO:0007744|PDB:6FMS

鎖名	残基	詳細
A	GLN31-GLY67
A	LEU119-ASN140
B	GLN31-GLY67
B	LEU119-ASN140
C	GLN31-GLY67
C	LEU119-ASN140
D	GLN31-GLY67
D	LEU119-ASN140

---

site_id	SWS_FT_FI3
残基数	168
詳細	TRANSMEM: Helical => ECO:0000269|PubMed:26912896, ECO:0000269|PubMed:30272004, ECO:0007744|PDB:5DIR, ECO:0007744|PDB:6FMS

鎖名	残基	詳細
A	TRP68-LYS89
A	TRP97-VAL118
B	TRP68-LYS89
B	TRP97-VAL118
C	TRP68-LYS89
C	TRP97-VAL118
D	TRP68-LYS89
D	TRP97-VAL118

---

site_id	SWS_FT_FI4
残基数	24
詳細	TOPO_DOM: Cytoplasmic => ECO:0000269|PubMed:26912896, ECO:0000269|PubMed:30272004, ECO:0007744|PDB:5DIR, ECO:0007744|PDB:6FMS

鎖名	残基	詳細
A	ARG90-THR96
B	ARG90-THR96
C	ARG90-THR96
D	ARG90-THR96

---

site_id	SWS_FT_FI5
残基数	52
詳細	TRANSMEM: Helical => ECO:0000269|PubMed:26912896, ECO:0007744|PDB:5DIR

鎖名	残基	詳細
A	LEU141-ALA154
B	LEU141-ALA154
C	LEU141-ALA154
D	LEU141-ALA154

---

site_id	SWS_FT_FI6
残基数	56
詳細	TOPO_DOM: Cytoplasmic => ECO:0000269|PubMed:26912896, ECO:0007744|PDB:5DIR

鎖名	残基	詳細
A	LEU155-GLY169
B	LEU155-GLY169
C	LEU155-GLY169
D	LEU155-GLY169

---

site_id	SWS_FT_FI7
残基数	8
詳細	ACT_SITE: ACT_SITE => ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_00161, ECO:0000305|PubMed:26912896

鎖名	残基	詳細
A	ASP124
A	ASP143
B	ASP124
B	ASP143
C	ASP124
C	ASP143
D	ASP124
D	ASP143

---