6DQ7

LINKED KDM5A JMJ DOMAIN BOUND TO THE POTENTIAL HYDROLYSIS PRODUCT OF INHIBITOR N45 i.e. 3-((6-(4-(2-cyano-3-methylbut-2-enoyl)-1,4-diazepan-1-yl)-2-(pyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl)amino)propanoic acid

PDBデータベースに由来する情報

site_id	AC1
残基数	16
詳細	binding site for residue H6M A 601

鎖名	残基
A	ARG73
A	GLU485
A	ASP486
A	ASN493
A	LYS501
A	GLN535
A	MN602
A	HOH714
A	TYR409
A	ALA411
A	ASP412
A	TYR472
A	SER479
A	PHE480
A	CYS481
A	HIS483

---

site_id	AC2
残基数	5
詳細	binding site for residue MN A 602

鎖名	残基
A	HIS483
A	GLU485
A	H6M601
A	HOH714
A	HOH726

---

site_id	AC3
残基数	5
詳細	binding site for residue EDO A 603

鎖名	残基
A	LYS50
A	ARG52
A	ASN556
A	HOH763
A	HOH771

---

site_id	AC4
残基数	8
詳細	binding site for residue GOL A 604

鎖名	残基
A	MET380
A	PRO381
A	GLU485
A	ASP486
A	HIS487
A	HOH712
A	HOH722
A	HOH809

---

SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報

site_id	SWS_FT_FI1
残基数	50
詳細	ZN_FING: PHD-type 1 => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00146

鎖名

残基

詳細

---

site_id	SWS_FT_FI2
残基数	4
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:26645689, ECO:0000269|PubMed:27427228

鎖名	残基	詳細
A	TYR409
A	SER491
A	ASN493
A	LYS501

---

site_id	SWS_FT_FI3
残基数	2
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00538, ECO:0000305|PubMed:26645689, ECO:0000305|PubMed:27214401, ECO:0000305|PubMed:27427228, ECO:0000305|PubMed:27499454

鎖名	残基	詳細
A	HIS483
A	HIS571

---

site_id	SWS_FT_FI4
残基数	1
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000305|PubMed:26645689, ECO:0000305|PubMed:27214401, ECO:0000305|PubMed:27427228, ECO:0000305|PubMed:27499454

鎖名	残基	詳細
A	GLU485

---

site_id	SWS_FT_FI5
残基数	1
詳細	MOD_RES: Phosphoserine => ECO:0007744|PubMed:23186163

鎖名	残基	詳細
A	SER464

---

site_id	SWS_FT_FI6
残基数	2
詳細	CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO2) => ECO:0007744|PubMed:28112733

鎖名	残基	詳細
A	LEU451

---