6DO2
Crystal structure of human GRP78 in complex with 7-deaza-2'-C-methyladenosine
GO(遺伝子オントロジー)由来の情報
PDBデータベースに由来する情報
site_id | AC1 |
残基数 | 10 |
詳細 | binding site for residue H5V A 501 |
鎖名 | 残基 |
A | GLY227 |
A | ASP391 |
A | GLY255 |
A | GLU293 |
A | LYS296 |
A | ARG297 |
A | SER300 |
A | GLY364 |
A | SER365 |
A | ARG367 |
site_id | AC2 |
残基数 | 13 |
詳細 | binding site for residue H5V B 501 |
鎖名 | 残基 |
B | TYR39 |
B | GLY255 |
B | GLU293 |
B | LYS296 |
B | ARG297 |
B | SER300 |
B | GLY364 |
B | SER365 |
B | ARG367 |
B | ASP391 |
B | HOH601 |
B | HOH635 |
B | HOH678 |
UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報
site_id | PS00297 |
残基数 | 8 |
詳細 | HSP70_1 Heat shock hsp70 proteins family signature 1. IDLGTTyS |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ILE33-SER40 |
site_id | PS00329 |
残基数 | 14 |
詳細 | HSP70_2 Heat shock hsp70 proteins family signature 2. VFDLGGGTfdvSLL |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | VAL222-LEU235 |
site_id | PS01036 |
残基数 | 15 |
詳細 | HSP70_3 Heat shock hsp70 proteins family signature 3. IvLvGGsTRIPkIqQ |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ILE359-GLN373 |
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
site_id | SWS_FT_FI1 |
残基数 | 10 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:21526763 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | GLY36 | |
B | GLY364 | |
A | LYS96 | |
A | GLY227 | |
A | GLU293 | |
A | GLY364 | |
B | GLY36 | |
B | LYS96 | |
B | GLY227 | |
B | GLU293 |
site_id | SWS_FT_FI2 |
残基数 | 2 |
詳細 | MOD_RES: Phosphoserine => ECO:0000250|UniProtKB:P06761 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | SER86 | |
B | SER86 |
site_id | SWS_FT_FI3 |
残基数 | 6 |
詳細 | MOD_RES: N6-acetyllysine => ECO:0000250|UniProtKB:P20029 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS125 | |
A | LYS213 | |
A | LYS326 | |
B | LYS125 | |
B | LYS213 | |
B | LYS326 |
site_id | SWS_FT_FI4 |
残基数 | 2 |
詳細 | MOD_RES: 3'-nitrotyrosine => ECO:0000250|UniProtKB:P20029 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | TYR160 | |
B | TYR160 |
site_id | SWS_FT_FI5 |
残基数 | 2 |
詳細 | MOD_RES: N6-acetyllysine => ECO:0000250|UniProtKB:P0DMV8 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS271 | |
B | LYS271 |
site_id | SWS_FT_FI6 |
残基数 | 2 |
詳細 | MOD_RES: N6-acetyllysine; alternate => ECO:0000250|UniProtKB:P20029 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS353 | |
B | LYS353 |
site_id | SWS_FT_FI7 |
残基数 | 2 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO2) => ECO:0007744|PubMed:25114211, ECO:0007744|PubMed:25218447, ECO:0007744|PubMed:25755297, ECO:0007744|PubMed:28112733 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS352 | |
B | LYS352 |
site_id | SWS_FT_FI8 |
残基数 | 4 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO1); alternate => ECO:0007744|PubMed:25114211 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS353 | |
B | LYS353 |