1S1Q
TSG101(UEV) domain in complex with Ubiquitin
GO(遺伝子オントロジー)由来の情報
PDBデータベースに由来する情報
site_id | AC1 |
残基数 | 6 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE CU C 9001 |
鎖名 | 残基 |
C | LYS101 |
C | HIS102 |
C | GLU138 |
C | HOH9042 |
C | HOH9086 |
D | GLU34 |
site_id | AC2 |
残基数 | 5 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE CU A 9002 |
鎖名 | 残基 |
B | GLU34 |
B | HOH9015 |
A | HIS102 |
A | GLU138 |
A | HOH9023 |
site_id | AC3 |
残基数 | 3 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE CU B 9003 |
鎖名 | 残基 |
A | HIS115 |
A | HOH9109 |
B | ASP32 |
site_id | AC4 |
残基数 | 5 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE CU D 9004 |
鎖名 | 残基 |
C | HIS115 |
D | ASP32 |
D | HOH9005 |
D | HOH9060 |
D | HOH9061 |
site_id | AC5 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 C 502 |
鎖名 | 残基 |
C | LYS16 |
C | ARG18 |
C | ASP19 |
C | HOH9087 |
site_id | AC6 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 503 |
鎖名 | 残基 |
A | LYS16 |
A | ARG18 |
A | ASP19 |
A | HOH9065 |
site_id | AC7 |
残基数 | 5 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 504 |
鎖名 | 残基 |
A | GLY100 |
A | LYS101 |
B | THR7 |
B | THR9 |
B | GLY10 |
site_id | AC8 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 C 505 |
鎖名 | 残基 |
C | THR92 |
C | SER93 |
C | HOH9082 |
D | ASN60 |
site_id | AC9 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ACY C 510 |
鎖名 | 残基 |
C | ILE70 |
C | PRO139 |
C | PRO140 |
C | VAL141 |
site_id | BC1 |
残基数 | 5 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ACY D 511 |
鎖名 | 残基 |
D | LYS27 |
D | PRO38 |
D | ASP39 |
D | ASP52 |
D | HOH9037 |
UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報
site_id | PS00299 |
残基数 | 26 |
詳細 | UBIQUITIN_1 Ubiquitin domain signature. KakIqDkegIPpdqQrLIFaGkqleD |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS27-ASP52 |
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
site_id | SWS_FT_FI1 |
残基数 | 4 |
詳細 | SITE: Interacts with activating enzyme |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | ARG54 | |
B | ARG72 | |
D | ARG54 | |
D | ARG72 |
site_id | SWS_FT_FI2 |
残基数 | 2 |
詳細 | SITE: Essential for function |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | HIS68 | |
D | HIS68 |
site_id | SWS_FT_FI3 |
残基数 | 2 |
詳細 | MOD_RES: Phosphoserine; by PINK1 => ECO:0000269|PubMed:24660806, ECO:0000269|PubMed:24751536, ECO:0000269|PubMed:24784582, ECO:0000269|PubMed:25527291 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | SER65 | |
D | SER65 |
site_id | SWS_FT_FI4 |
残基数 | 2 |
詳細 | MOD_RES: (Microbial infection) ADP-ribosylthreonine => ECO:0000269|PubMed:32330457 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | THR66 | |
D | THR66 |
site_id | SWS_FT_FI5 |
残基数 | 2 |
詳細 | MOD_RES: ADP-ribosylglycine => ECO:0000269|PubMed:28525742 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | GLY76 | |
D | GLY76 |
site_id | SWS_FT_FI6 |
残基数 | 2 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:16443603 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS6 | |
D | LYS6 |
site_id | SWS_FT_FI7 |
残基数 | 4 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Gly-Lys) (interchain with K-? in acceptor proteins) |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | GLY76 | |
D | GLY76 |
site_id | SWS_FT_FI8 |
残基数 | 4 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:16443603, ECO:0000269|PubMed:16543144 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS11 | |
B | LYS48 | |
D | LYS11 | |
D | LYS48 |
site_id | SWS_FT_FI9 |
残基数 | 2 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000305|PubMed:15466860 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS27 | |
D | LYS27 |
site_id | SWS_FT_FI10 |
残基数 | 2 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:16543144, ECO:0000269|PubMed:25752573, ECO:0000269|PubMed:25752577, ECO:0000269|PubMed:34239127 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS29 | |
D | LYS29 |
site_id | SWS_FT_FI11 |
残基数 | 2 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:25752577 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS33 | |
D | LYS33 |
site_id | SWS_FT_FI12 |
残基数 | 2 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:16543144, ECO:0000269|PubMed:18719106 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS63 | |
D | LYS63 |